El blog del SEXTANTE

Important notice for gvSIG users

2011-12-21T13:37:00.001+01:00

Here is an email that I am going to send to the gvSIG mailing lists:

SEXTANTE and gvSIG CE teams have decided to unite forces and will be, from now on, sharing their development policies and strategies, along with some elements of their web platform (we were already using their bug tracker). Our mailing lists and SVN repository have changed, and you can check the details in our website (sextantegis.com).

This mail is to clarify how this afects SEXTANTE users and, more specifically, how future SEXTANTE releases (starting with v1.0, which will be released in a few days) will be integrated in both gvSIG CE and the official gvSIG distributions. Users of other GIS's should not worry about this. Although we will now share elements of the gvSIG CE platform, we will keep on working for other applications using SEXTANTE as we've been doing until now, and we will not abandon them.

The following points clarify the main ideas of the SEXTANTE project regarding gvSIG

-We strive to have SEXTANTE running on a large number of platforms in a robust and stable manner. Although gvSIG has been our prefered platform until now, we've found many problems in both the technical and organizational parts of the gvSIG project. This is the main reason why we are supporting the gvSIG CE project, as a better alternative for SEXTANTE users.

-Instead of keeping different versions of SEXTANTE for gvSIG and gvSIG CE, there will be only one. However, when running on the official gvSIG, some of its features will not be available, since they need some improvements made in the gvSIG CE version, which are not included in the official version. The current available gvSIG CE version is a Technical Preview and does not incorporate all those changes, but they will be included in the final stable version. As of today, there is no difference in running SEXTANTE from gvSIG CE or the official gvSIG, but changes will be important once the stable version of gvSIG CE is released. Advanced users using the current gvSIG CE SVN code can already try them.

-As it was announced in the 7th gvSIG conference this month, the gvSIG project has decided to create its own geoprocessing platform, replacing SEXTANTE. It's likely to be heavily based on SEXTANTE (it is a fork of it), but it is not the official SEXTANTE platform, so it might not include the latest changes made in SEXTANTE. We will, however, release official SEXTANTE versions specifically targeted at gvSIG users, which will be easy to install, since they will use the new gvSIG add-ons manager. SEXTANTE users will be able to install official SEXTANTE releases in gvSIG, just installing the corresponding packages that we will publish in our website. (In other words...do not worry, you will still have the good old SEXTANTE to use with whatever gvSIG version you prefer)

-Overall, we recommend all gvSIG users who use SEXTANTE to switch to gvSIG CE (once again, we're talking about the yet-to-be-released stable version, so is not an important issue right now) as a better alternative regarding SEXTANTE integration. Other features not related to SEXTANTE are, in our experience, also more reliable than those in the official version.

Thanks once again for using SEXTANTE, and we hope you enjoy our new release and keep on using SEXTANTE for your spatial analysis in gvSIG.

Regards

Victor Olaya
SEXTANTE

Kinda goodbye...

2011-11-23T22:03:00.000+01:00

It's been almost 8 years since I decided to start the SEXTANTE project. I had an idea and I wanted to spend some time developing it and, why not, make a living from it. I ended up finding the funding I needed here in Plasencia, so I relocated from my hometown in Madrid and discovered a great city with great people, a small but charming university and the best environment I could dream of to develop what SEXTANTE is now.

I never expected SEXTANTE to grow this big and to have such an impact in my life, and I guess I can't do but thank everyone for these wonderful years.

If this sounds to you like a farewell notice...I am afraid you are right. Although I still love GIS and programming, I feel that time has come for me to do something different, and from January I will not be here anymore and I won't work full-time on SEXTANTE as I have been doing until now. I still plan to do some work, since I do not want to completely abandon SEXTANTE, so I will probably be fixing bugs and making small changes (and maybe adding some entries to this blog...). However, you cannot expect big changes or important new features to be added in the short term. At least, not done by me...but I would love to manage the SEXTANTE developers community and help them improve SEXTANTE if they want to do so.

There is still one month until all this happens, and I am working hard to release a new version with all the current changes and bug fixes. I also hope to make it easier for applications using SEXTANTE to incorporate these changes (gvSIG and gvSIG CE will both be releasing a new version soon...)

I would like to thank you all for being there and supporting SEXTANTE. This incredible time that is now ending for me would have not been the same without your support. And I hope that SEXTANTE will still be alive for a long time thanks to your collaboration, whether you are a user or a developer.

Out of office

2011-10-19T14:26:00.000+02:00

I am taking holidays tomorrow...and won't be back until the end of November. Don't worry if you do not see much activity in SEXTANTE during the following weeks. I would have loved to have more time to finish the R interface a bit more...but I will resume working on it as soon as I come back.

I usually do not check my email when I am travelling, so do not expect me to answer email or questions during these days. I hope that the last improvements of SEXTANTE can keep you all busy and having fun during this month :-)

See you all soon!

R

2011-10-19T14:20:00.000+02:00

I have finaly finished a first version of the R-SEXTANTE interface. R algorithms and scripts can now be called from SEXTANTE, as is shown in the next videos:

The first one calls them from gvSIG, while the second one does it from ArcGIS. There are still a couple of additional things to be fixed in ArcGIS, and it won't take loong to do it, but I wanted to upload this notice before going home. I am pretty excited about this new development, since the possibilities of incorporating R in SEXTANTE are almos endless :-)

As you can see, there are just a few algorithms available. Unlike GRASS or SAGA, R algorithms and scripts are not incorporated automatically. Description files have to be created manually. This is very simple to do, and I expect R experts to help us with that (I am not an R expert, just have a very very basic knowledge of it). I have created a few description files as examples, and also created a small manual to document how to do it. You can find it in the documents section of the SEXTANTE website.

I hope you like this new improvement as much as I do.

About the SEXTANTE support for 3rd party algorithm providers

2011-09-15T11:46:00.000+02:00

I have been receiving many emails lately about the support for SAGA and GRASS in SEXTANTE, how to configure it and what is our policy about that. Also, I am helping a colleague to create the custom distribution for the SEXTANTE course organized by the gvSIG Association that he will teach in October, and a few similar issues have arisen. For this reason, I am writing this entry to clarify all this, hoping that it will help users and integrators of SEXTANTE.

The main idea is that, due to inestability problems, we have decided that the installation process has to be done in advance and cannot be done by the user. Letting the user do this is error-prone, since different versions can be used and there are many others things than have to be controlled. We believe that this in not good for SEXTANTE, so we will support only preconfigured systems.

For this reason, the SAGA and GRASS providers will only be available if the application includes SAGA and GRASS and they are correctly preconfigured.

So far, this is the situation regarding the main GIS software that uses SEXTANTE:

-gvSIG CE will ship with both and SAGA and GRASS, and will be thus complete with all algorithms.

-Official gvSIG will ship (AFAIK) without them, and will have no support for SAGA and GRASS. This might, however, change, since we are working with them to prepare for their next release and we haven't discussed that carefully. Right now, there are two different bindings for these two flavors of gvSIG, and the SAGA/GRASS support is the main difference between them (though not the only one)

-SEXTANTE for ArcGIS will include a running version of SAGA (Windows only), but no GRASS, since we are not completely happy with the behaviour of the SEXTANTE/GRASS interface when running under ArcGIS. This distribution can already be downloaded from our website (still a beta, not a final release).

-OpenJUMP will have no support for external providers (mainly due to our lack of time to work on it...sorry)

SEXTANTE algorithms in the ArcGIS Model Builder

2011-08-30T11:15:00.000+02:00

This new video shows how SEXTANTE algorithms can run in the ArcGIS Model Builder. The model is a very simple one, but executes a SAGA algorithm (convergence index) and a native SEXTANTE one (Histogram). Since the result is a histogram chart, it has to be viewed using the SEXTANTE results window, which is now available from an add-in that I developed, which adds a button to open it.

SAGA and GRASS running in ArcGIS through SEXTANTE

2011-08-30T10:20:00.001+02:00

Here is another video of SEXTANTE on ArcGIS. This time, I am showing how SAGA and SEXTANTE algorithms can be executed just like native SEXTANTE algorithms. This is completely true for SAGA ones, but I'm having a bit of trouble with GRASS ones, specially vector ones. This is not a GRASS or SEXTANTE problem, but just a problem caused by the strange behaviour of Java when I call the application (SAGA or GRASS) from ArcGIS, since it freezes and I haven't been able to solve it. If I execute a new interpreter (that's why the command line window is shown), it works but it returns the control back to the Java code before the task is finished. All this doesn't happen when calling the, from a pure java application, like OJ or gvSIG, so I have had to rewrite part of the GRASS interface in SEXTANTE. The SAGA one is simpler, so just a minor tweak was needed.

Anyway, I will keep on working on this, but for now SAGA algorithms are fully available, and I hope that GRASS ones will soon be as well.

Both native SEXTANTE algorithms and SAGA/GRASS ones also work within the Model Builder. I am preparing a video about that that I will post soon.

ArcGIS coupled with SEXTANTE SAGA and GRASS is really a powerful geospatial analysis app, bringing together the best of both worlds: propietary and open source. Needless to say, it makes me really happy to see that SEXTANTE is the bonding element responsible for that.

First video of SEXTANTE for ArcGIS

2011-08-16T11:51:00.000+02:00

Here is a first video of SEXTANTE for ArcGIS, so you can see what it is like to access the power of SEXTANTE from the popular ESRI product. I recommend to watch full screen or at least at a larger size then the embedded video, to fully see what is going on in the screen...

As you can see, output results are not added automatically to the view (I haven't figured out how to do it yet...and this is the one single thing that I can't find documentation about...Anyone can help??), but the remaining elements of the SEXTANTE-ArcGIS interaction are already implemented and seem to be working pretty fine.

I still want to do some more testing and solve a few minor issues, but everything is going fine and the next version of SEXTANTE will for sure ship with fully-working ArcGIS bindings

We are all very excited about this development, since it means a big step in the (short but intense) history of SEXTANTE :-)

Adding external functions from gvSIG to SEXTANTE, and more.

2011-07-18T08:40:00.000+02:00

The folks at the gvSIG Community Edition project are doing an awesome work trying to create a better version of gvSIG, and they are putting a lot of effort in trying to enhance the integration of SEXTANTE. After 3 days of fruitful and really fun work (met with them at AGIT, in Salzburg), we believe that gvSIG CE is going to become the best platform for using SEXTANTE and, thus, support their work and have given some advise about how to better integrate SEXTANTE with their software. Also, I have made a few changes that will greatly improve the experience of using SEXTANTE and will give gvSIG CE users new posibilities. The most important are the two following ones:

1)Introduction of Toolbox Actions. A toolbox action is just a command that you can call from the toolbox, so now you can have not only SEXTANTE algorithms but any other thing that you want. Of course, this actions cannot be used in other elements of SEXTANTE like the modeler, but it is handy to have some functionalities close to your geoalgorithms. Why is this useful for gvSIG CE? Well, we all now that the current distributions of icons and menus is a mess in gvSIG. There is a geoprocessing toolbox with just vector algorithms, then there is a network analysis interface and finally there are some raster functions that you can access from an awkward double-drop-down-list system in the toolbar. Having all of them together would make the interface much more homogeneous and easy to use, so the idea is to create actions to call those elements and then remove their corresponding menus and icons. Everything related to spatial analysis will be found in the SEXTANTE toolbox.

The idea of having just one geoprocessing framework has been around in gvSIG since many years ago, but it is easy to see that using that framework hasn't been really enforced by the gvSIG team. Of course, it would be better to have all those functions as real SEXTANTE algorithms. Although we plan to do so, that means a lot of work, so this solutions is good by now until we have a better one.

2) Changes for a portable version. The first version of gvSIG CE will be a portable one (no need to install anything), bundled with GRASS and SAGA and fully preconfigured. That means that you will have more than 700 algorithms from the very first time you run the software and there will be no need to configure anything about SAGA or GRASS. This wasn't possible before, since configuration files were kept in a user folder, and thus it was not very portable.

Also, Benjamin Ducke, the frontman of the gvSIG CE version, is responsible of developing most of the GRASS interface in SEXTANTE, so we worked together on that and made a few changes. We both agree in that a bundled installation of GRASS or SAGA is prefered to an external one, and we made changes in that direction, in order to have a more robust integration assuming that the user has a preinstalled copy of any of these addtional softwares.

The fist version of gvSIG CE will be out soon (its release will probably be synchronized with the release of SEXTANTE 0.7) and we highly recommend everyone to try it, specially if you work with SEXTANTE. As I said, we see this version as the ultimate SEXTANTE platform, since it has been specifically adapted and solves some important issues.

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Is propietary software better for developers?

2011-06-24T20:49:00.002+02:00

I have recently been programming the SEXTANTE bindings for ArcGIS (they are not finished yet, since I am having a very busy week with other priorities, but I will resume working on them next week and hope to have them ready soon) and working with the ArcGIS API has made me think a bit about how the propietary software model can somehow be an advantage for a certain kind of developers. I am not, of course, saying that propietary means better (I will always prefer open source to propietary), but there might be a few things that we can learn from propietary software developers and some positive side effects of not sharing your source code.

This all comes from the following fact: being a complete ignorant about ArcObjects and the ArcGIS API, I have been able to create the corresponding SEXTANTE bindings from scratch in less time than I needed to create any other bindings before. That means less time than the gvSIG bindings (an application that I knew pretty well), and way less than the OpenJUMP or Geotools ones (both of them softwares that I had worked with before, at least once).

This is basically due to the clean, well designed and perfectly documented API of ArcGIS, which, along with the additional Eclipse plugins, makes it very easy to develop new plugins and extensions for the software. Unfortunately, open-source GIS lack that kind of APIs, or they are, at least, not so carefully designed, documented and implemented. Although other factors might concur, I am convinced that the propietary nature of ArcGIS is a decisive one to have such a powerful and developer-friendly API.

Let's put it this way: ArcGIS developers want other developers to create plugins for their software, so they have to provide an easy way of doing so. However, they cannot let you see the source code or their application, so they have to make sure that everything that an external developer might need to create his plugin is correctly exposed through their API. The API has to, somehow, replace the source code for certain development tasks. On the other hand, open-source programmers are aware of the importance of developing a correct and well documented API, but the availability of source-code might act as an excuse for sloppy or unfinished APIs, assuming that, if an external developers misses anything in it will search the source code and try to find whatever he is missing.

That doesn't necesarily mean that open-source APIs are not as good as proprietary ones, but, while an open-source software, even if it lacks documentation and has a poorly designed API, it is still useful (albeit frustrating) for a developer, the same circumstances will render a proprietary software useless in term of development. That alone should encourage proprietary software developers to create and document practical and useful API (and we all know that this is important, since that is not always a nice and rewarding task...)

Once again, I insist that I am not praising the proprietary model, but just trying to find its benefits and trying to learn from it and apply it later to my open-source projects. I believe that everyone can teach us something and there is always something to learn from everyone. And, although I am not one of those who see proprietary software as an enemy, even enemies can teach you a few valuable lessons and it is not a good idea to ignore them. Quoting the much-missed Rage Against the Machine: Know your enemy :-)

Bug Tracker

2011-06-15T19:17:00.000+02:00

I am pleased to announce that we already have a fully-working SEXTANTE bug tracker. Instead of using OSOR's one, we are now sharing the gvSIG CE (Community Edition) tracker. I will soon put a link on our website. In the meantime, here is the tracker URL:

http://gvsigce.sourceforge.net/mantis/main_page.php

This also shows our commitment to help this interesting initiative, and we will probably use the Wiki and forums of the gvSIG CE project, hoping it might help to unite all SEXTANTE/gvSIG users and work together to improve both software packages.

Scripts as algorithms

2011-06-06T14:22:00.000+02:00

i have been improving the command-line interface and I have added one new feature that I guess will be interesting for SEXTANTE power users.

The command line interface allows the creation of scripts that can be put in a separate file and then executed with the source(filename) command. If a method is written to to that file, then executing the file will make the method available in the current command-line session.

For instance, if we have a method like the next one,

mymethod(rasterLayer, vectorLayer){
//do something with those layers
}

executing the corresponding file will add a new method calle "mymethod" that I can use anytime.

Since we are running a scripting language, there is no need to specify data types for method parameters. However, now, if you add some information about those types as comments before the method, SEXTANTE can not just execute them from the command line, but also from the toolbox as a normal algorithm.

The above method should be something like this:

//rasterLayer=raster
//vectorLayer=vector
mymethod(rasterLayer, vectorLayer){
//do something with those layer
}

Those two comments are used by SEXTANTE to create the corresponding dialog.

If you put the bsh file in the scripts folder (which now you can define in the settings dialog), the method it contains will appear automatically in the toolbox as any other algorithm or model.

I still have to work more on this and document it, but I guess it's a nice beginning for a rather intereesting idea.

some little improvements

2011-05-31T13:56:00.000+02:00

Most of my work in this last days has been solving minor bugs and adding small improvements to the SEXTANTE GUI. Here is a quick review of some of them. Not all of them have been finished and tested yet.

-Optional outputs. There is a new output channel (NullOutputChannel) that basically does nothing with the result of an algorithm. It can be selected from the output channel selection dialog, and doing so causes SEXTANTE not to create the corresponding output layer. This was, you can have optional outputs, but there is no need to set them as optional in the source code of each algorithm o take that into account somehow.

-GRASS algorithms in modeler. GRASS algorithms work now in the modeler, and I have already implemented a mechanism for dealing with the major issue: layers with more than one geometry type. When you execute a GRASS algorithm now, in case it generates vector layers with muliple geometry types, you have to select the type of geometry you want to use (the other ones are discarded). The selection is already implemented, but the GrassAlgorithm class is not using it yet. I will code that in a month or so, when I go to Salzburg to atend the AGIT conference, since we plan to have a code sprint there with other developers who know more than me about GRASS...

-Definition of analysis extent using stored points. Point stored using the catch coordinates tool can now be used to manually define the extent of the analysis region.

New website and video tutorials

2011-05-11T13:43:00.003+02:00

Maybe you have already realized that I have changed the sextantegis.com website. Instead of redirecting to the OSOR wiki, now it redirects to a minimalistic nice-looking web page, which is, IMHO, much better and more practical.

If you go to the website, you will also see that there is a link to our brand new YouTube channel. I have already uploaded 13 video tutorials (around 3 min each), and plan to add many more in the following days (I try to do 1 or 2 each day...). I am recording them in english, in order to make them useful for everyone (I absolutely do not like my accent, but I hope you find them interesting anyway ;-) ).

Here is a quick list of all the ones that I want to have ready soon:

-the toolbox
-the parameters window
-the output region tab
-output channels
-Results
-tables
-configuration
-history
-capturing points
-the graphical modeler
-modeler inputs
-modeler inputs(II)
-modeler algorithms
-saving and configuring models
-batch processing
-batch processing(II)
-batch processing from open layers
-Numerical results
-Iterative execution of algorithms
-Basic operations with raster layers
-Focal statistics
-Local statistics
-Geomorphometry
-Geomorphometry(II)
-Hydrology
-Hydrology(II)
-The raster calculator
-Using masks
-Overlay operations with vector layers
-Dissolving vector layers
-Basic spatial statistics with vector layers
-Basic transformations for vector layers
-Basic transformations for vector layers(II)
-Creating profiles
-Creating a raster layer from a set of points
-Creating a density layer

Many more can be added to that list (and you can be sure that I will do it), but I would like to have your opinion. Is there anything that you would like to see there? Any process that you would like me to document in a video? If so, please feel free to tell me. I think video tutorials are great and easy to make, so all suggestions are welcome.

On ultrarunning, GIS and programming on the run.

2011-05-02T17:30:00.002+02:00

Those of you that do not know me personally probably do not know that one of my biggest passions is running. And when I mean running, I mean running *a lot*. I have been into endurance sports since I was a kid, and since a few years ago I am a passionate ultrarunner, that meaning that I enjoy a 20 km run, but I have real fun when I get out of home early in the morning and come back home several hours later in the evening with 60-70 km [~43 miles for those not used to the International System] on my legs.

To run such long distances, a fair amount of physical endurance is needed but, more that that, a great psychological endurance is the key. As the classic ultrarunning mantra goes: "pain is inevitable, suffering is optional", and each ultrarunner has his own strategy for ignoring the pain and turning a long run into a rewarding (albeit painful) journey. Some like to listen to music, others simply think about their life. Dean Karnazes, by far the most popular ultrarunner around, wrote most of his best-seller "Ultramarathon man, confessions of an all-night runner" while running, recording his thoughts into a portable recorder and later transcribing them.

Now you must be wondering why I am writing this in this blog about GIS, SEXTANTE and programming. Well, there is a link between SEXTANTE and running, and I would even dare to say that SEXTANTE would not be the same if it were not for my long weekend runs. I do not like to listen to music while I run, and I definitely do not feel like bringing a recorder with me when I go running, but there is something that I love to do when I run. Guess it? That's right: programming. (Another thing that I usually do is to practice scales...but I have a blog about music to talk about that, so I will not bore you here with the details ;-) )

As the great Edsger Dijkstra said, "computer science is not more about computers than astronomy is about telescopes". In other words, you do not need a computer to program. Of course I do not do actual coding while running, but programming is much more that just typing code. Design and optimization are two of the things that can be done without having a computer in front of you. In fact, I have realized that I tend to code too much and think less than I should if I am sitting in front of a computer, so it is better for me to spend sometime "working" without a computer. Staying away from the computer lets me concentrate on details that I might overlook if I am typing code.

Also, running for several hours to the edge of exhaustion gives you an extremely clear thought once you get past the point where your mind and your body separate (and believe me, this happens sooner or later in every long run...otherwise your body would say no and stop), so, somehow, you get "cleverer" as you run. That makes it an ideal situation for thinking about such abstract problems, and for finding optimal solutions to them.

I am writing this here because, as I mentioned in some of my latest posts, there have been some important new functionalities added to SEXTANTE in the last weeks. Most of these new functionalities involve changes in the architecture of SEXTANTE and, thus, require not just coding, but also rethinking part of its design. And, as you might have probably figured out, I did a big part of that while running. The feeling of arriving home, eating something, having a shower (or, better, a freezing ice bath) and sitting in front of the computer to put your ideas to practice is just great, letting your thoughts flow and turn into code. Definitely, much better that sitting in my office at the university (although I usually go for a short early morning 10-15km run before going to work), and by far much more productive.

Now a question to all programmers around: Do you have any preferred moment of the day to work? Anything you like to do to get ready or boost your productivity and/or creativity?

By the way, I thought about this post and "wrote" most of it a few days ago on my mind during a long and beautiful 190+ km (half of them under pouring rain...) bike ride on the almost-abandoned roads around my town. Also, whenever I have a presentation or talk, I usually rehearse it while on the run, so I guess that SEXTANTE owes more than just code to my running/cycling sessions :-)

Organizing your algorithms

2011-04-28T19:32:00.005+02:00

Benjamin Ducke posted an email yesterday to the SEXTANTE mailing list, pointing out the need to have some mechanism for creating your own toolbox groups and organizing algorithms, since the number of them is currently rather big due to the SAGA and GRASS interfaces. Instead of replying to his email, I have been reading the fruitful discussion that followed and implemented a first solution to that problem. And since I believe that I have done a nice work (specially considering that I have been working on this just today), I am posting this to the SEXTANTE blog to let everyone know about it. Here is what I have done:

-List of recently used algorithms. There is a group of algorithms that contains the most recently used ones and appears always at the top of the list. I might add an option to remove this group in case someone does not find it useful.

-You can arrange your algorithms as you like. Each algorithm has a provider name (Currently SEXTANTE, GRASS, Models or SAGA) and a group name. If you go to the SEXTANTE settings you will find a "configure algorithm groups" button. If you click on it the following dialog will appear:

Just change the name of the group and subgroup (the provider name and the group name) to put an algorithm on a different brach of the tree of algorithms. If you do not want an algorithm to appear, just uncheck its checkbox.

As you can see, this works even with non-native algorithms (see the SAGA label?). This is another advantage of the new architecture based on algorithm providers :-)

Groups are stored in a text file that is loaded when SEXTANTE is initialized, but I will probably implement some way of selecting your own file, so you can have several configurations. Other improvements might include sorting the algorithms table clicking on a column header or editing several algorithms in one single step. Still many things can be done, but, after all, I have just been working on that less then one full day!

All this changes have effecct both in the tollbox and in the graphical modeler.

Big changes in SEXTANTE (II)

2011-04-25T18:25:00.000+02:00

More changes:

-Overwriting: Until now, SEXTANTE algorithms could just generate new layers and never modify existing ones. While this is a good idea most of the times, in certain cases it must be better to just alter an input layer instead. This is the case, for instance, with the "calculate geometrical properties of polygons", which adds new fields to the attributes table of a vector layer. I have done some changes to take that into account, so algorithms now can define a link between input layers and output ones. If such a link exists, the parameter setting dialog will give the option to overwrite the corresponding input layer instead of typing an output filename.

To make this easier, I have changed the output filename panel and its behaviour. Before this, it was just a text box with a small button. Clicking on the button caused the fiel selection dialog to appear, and the textbox contained the selected filename. A blank filename forced SEXTANTE to use a temporary filename.

Now, when you click on the button, you see a more complex dialog with several tabs. In the first tab, there are two buttons: one to select a temporary output file and another one to overwrite the corresponding input, in case it is possible. The second tab is used to select a filename. More tabs can be easily added, defining different ways of storing the resulting layer. In the case of vector layer, a "database" tab appears. However, this is not functional yet, but will allow the user to select a database table as the destination for the layer to create.

The overwrite functionality is compatible not only with file-based outputs, but also with other ones, like databases. I still have to solve what happens when a layer that cannot be overwritten is selected as input, and other similar small issues. Apart from that, I think that this is also a great advance in SEXTANTE and opens many new possibilities. Once this is fully functional, I will have to adapt some algorithms, but I hope that it will not take long to do.

These functionalities (the ones detailed in this post) come mostly from the suggestions from the Deputacion de Pontevedra, who needs this kind of capabilities for their work and pointed us in the right direction (apart from funding the project that resulted in the implementation of this ideas!), so we would like to thank them for their suppport.

Big changes in SEXTANTE

2011-04-23T14:20:00.004+02:00

I have been making some important changes in the last 2-3 weeks and, although I still have to test them an finish a few things, most of there are already working. These changes are rather big, since they involve modification of the SEXTANTE core architecture and, specially, the sextante_gui project. Here is a detailed description of some of them.

-Removal of WPS client. The WPS client was not working and it was somehow difficult to mantain, so, after asking SEXTANTE users and developers on the mailing lists, I decided to remove it. I guess that no one was using it, and the idea was not just removing it, but reimplementing it in a different way. Removing the project was not as easy as just taking a project away, but required some changes in the core classes as well. That made me see that its design was not right, and made me think about a new way of implementing extensions to the set of native algorithms of SEXTANTE. And that's how I came up with the next big change: Algorithm Providers

-Algorihtm Providers: Along with the basic set of algorithms (those programmed in Java using the SEXTANTE base classes), SEXTANTE includes algoritms from different sources. The WPS client was one of those sources, as well as the modeler or the GRASS interface. However, all these were developed independently and needed some adjustment in the core os SEXTANTE. Although a model or an algorithm coming from GRASS is technically a SEXTANTE geoalgorithm (it extends the GeoAlgorithm class), there are some minor differences, and I solved the problems associated with those differences by adding some patches to the SEXTANTE core.

This is, however, not a very clean option, specially considering that other sources of algorithms might be added in the future. For this reason, I decided to create a mechanism for "plugging" algorithm sources in a clean and robust manner. What I have done is to create an interface named IAlgorithmProvider and methods to add ojects of this class to SEXTANTE before initializing the library, so the list of algorithms is enriched with the algorithm it provides.

An algorithm provider takes care of everything needed to incorporate algorithms, from the particular characteristics of their execution, to the location of their associated help files, and including things such as the configuration panel that the provider might need or the icon of the algorithms in the toolbox and the modeler. With this change, all algorithms behave exactly the same and there is no need to add patches to the core classes. For instance, there was a "model" command in the command line interface to execute models. Now there is just the "runalg" algorithm, and it can be used to execute any algorithm, no matter if it is a model or a GRASS algorithm or it comes from any other provider yet to be developed.

After making these changes to the core classes, I have created 3 providers. The first two ones simply adapt the modeler interface and the GRASS interface, so now they are not part of the core classes. Adapting them has been relatively easy, although the GRASS one needs some testing yet, and I have detected a few issues while rewriting it. The third provider wraps SAGA algorithms and it took me just a couple of days to develop (still need to test it in linux and add some minor stuff, but it is almost done). This is partly due to the good knowledge I have of SAGA after speding many years using it and developing many of its modules, but also due to the new SEXTANTE design, which makes it very easy to incorporate third-party algorithms through an algorithm provider. Here is a picture of the toolbox, with both SAGA and GRASS algorithms activated.

More info about other changes in the next post, to come soon...

Reasons why I use Windows

2011-04-18T12:25:00.004+02:00

Being an open-source programmer that uses Windows (and openly prefers it to any other operating system, Linux included) can cause you a bit of uneasiness in certain contexts. While using Windows can be frowned upon among other open-source programmer, sometimes it goes beyond that and I have to listen to endless minutes of dreadful techno-proselytism from people who, for some reason, believe that I have never opened a Linux box and that I should give it a try and that will inmediately change my whole life. Tired of hearing people asking me things like "how can you still use Windows instead of Linux?", "I do not understand how you can work with that..." and other similar ones, here is a detailed explanation of why I do what I do. Also, this is meant to serve as a reflection about open-source software and will give you some ideas about how I understand the open-source software movement and the software industry in general.

Here we go.

1)I like Windows.

This reason alone should suffice, since, basically, we all do what we like and it makes no sense to select the option that doesn't fulfill you expectations and leave aside the one that makes you happy. I spend a lot of hours in front of the computer and I prefer to do it using Windows than Linux. As simple as that. However, let me justify this with some more "professional" arguments.

As you might now, I take productivity very seriously in my work, up to the point of having no mouse or touchpad in my computer, since doing everything using the keyboard is way more productive (although it needs some training) for the kind of work that I do (that is, programming). I worked more or less one year with a Linux-only PC and my productivity was not as high as when using Windows. This is not something that I just "felt". If I was just coding, there was no difference, since I could use eclipse on both systems, but as soon as I did complex tasks involving several applications, I was less productive when using Linux. I benchmarked it using a couple of common tasks, and I concluded that, for some reason, I feel better on Windows and that it affects my productivity. It is just a matter of taste, just like some people drink coffee and others drink tea, or some listen to blues while others listen to classical music. So I am not saying that Windows is better, but just that, for me, it feels better. And I worked one year using only Linux, which I think is a long enough period of time to start comparing.

2)I run a highly tuned-up Windows.

Windows users are bad users, we all know that. They log-in with administrator priviledges and have difficulties doing common tasks. On the other hand Linux users have a great knowledge of their system, they have read a few books about it and read man pages for dozens of commands. However, not all Windows users are the same. Some of them, like myself, like to read about Windows, about how to use it properly, and with each new version of Windows check as much documentation as possible in order to find out the improvements of their operating system. And, for this reason, I can tweak my system just like any Linux user does and take the most out of it.

For instance, my computer has one administrator user but as many as five other user profiles, each of them adapted to a particular kind of work. And the "switch user" option is disabled, so changing the user requires to log off. My "working" profile makes it very easy to use eclipse but terribly hard to use any other application, so I have to concentrate on programming. The "general" user profile, on the other hand, has a one-letter shortcut for each application, so I can launch any application pressing [windows key] + R, typing one letter (c for Chrome, e for Eclipse...) and pressing Enter. The start menu is empty, so there is no way of launching apps otherwise. Another profile that I use for writing has no internet browser, since I never need that when I write, so I avoid unnecessary distractions.

Of course, you can do things like that on Linux, but how many of those saying "I cannot work on Windows" have ever taken the time to configure the system like that? Also, how many of them have the same skills on Windows as they do on Linux?. As a curious case, I can tell you of a professor that came to lecture to our university and said that he needed his Linux machine, since he liked to have several apps open along with his slides and change between them quickly, and that could be done only using several desktops in Linux, something that was not possible in Windows (he added a few adjectives here to make clear that he was convinced that Windows was a useless operating system). I was pleased to show him that the alt+tab key combination can be used to switch between open applications, and that it can be used both in Linux and Windows. He didn't know about it :-)

A fine-tuned installation of Linux is, for sure, better than an out-of-the-box installation of Windows, but not necessarily better that a properly configured Windows.

3) But Linux is free!!

I am sorry, but freedom itself is not a reason for using something. As much as I love the open-source philosophy, it is not enough to make me use something that makes me be less productive in my work and have (once angain, for me) a worse user experience. For die-hard Linux fans, that seems to be more that enough, as long as they keep fighting against the cruel, inhuman, proprietary software companies leaded by Micro$oft. Not my case, definitely.

It's funny to see how, however, most of these people buy books (thus supporting the way less-than-fair publishing companies) or records (empowering record labels and their long-ago outdated business model) while free alternatives exists. Of course, they prefer to listen to a contemporary rock band and read the latest techno-punk novel instead of downloading the complete recordings of jazz pioneer Jelly Roll Morton to their mp3-players or the complete works of Homer (written before copyright laws even existed), both of them in the public domain and freely available from a dozen of sites on the Internet. Why? Simply because they prefer their bands and writers and do not mind buying their works. Easy to understand. Now you go to point 1...

I also find it funny how we tend to think that a software distributed under a proprietary license has to be per-se a bad software. A brilliant piece of software can be distributed by a greedy company under draconian conditions, and still be technically awesome. For some reason, this seems to be difficult to understand when we speak about software, but not so much when we speak about music of literature. Metallica sued their fans for downloading their tunes using Napster, but no one (even those being sued) questioned them as probably the biggest metal band ever. They questioned them as persons, not as musicians. Similarly, no literary critic would question "Journey to the end of the night" as one of the finest novels of the XX century, although his author, Louis Ferdinand Céline, was a fascist that, along with his masterpiece, wrote quite a few anti-semitic pampleths. But, however, many people judge Windows not from a purely technical point of view after using it, but based on what they feel for Bill Gates or how much they detest the aggresive and stupid style of Steve Ballmer.

We should separate the software itself from the license, and specially, not asumme that being free makes a software better. Free software can be awful or it can be great, and it does not depend on its license but, most of all, on the programmers behind it. And, like it or not, there are awesome programmers on both sides of the proprietary vs free software world. Since this is a GIS blog, let me tell you a little secret. I get angry each time I hear about ArcGIS licenses and, specially, how the spanish distributor deals with them. Their policy is, to say it mildly, disgusting, But, regarding the software itself, I absolutely love it and would kill for having a look at its source code. The programmer in me likes to look at sofware as something with no license at all, just like a technical element not linked to any social or economical element.

I hope that this long post has helped you think a bit about this interesting topic...

Comment are welcome :-)

English

2011-04-06T08:15:00.002+02:00

One of the main problems (IMHO) of SEXTANTE is its lack of a comprehensive user documentation. The main reason for that is that writing documentation for each single algorithm is boring (at least, more boring than developing the algorithm itself), and also that my time is limited and I prefer to do other things instead of updating the two versions of the SEXTANTE help currently available: the one in English and the one Spanish.

For this reason, I have just taken the solomonic decision of focusing only in the English documents, and not update the Spanish ones anymore. This full commitment to a single language is something that is needed to end up having a usable documentation, specially considering the small number of people working in the project.

So, in short, from now on there will be no more Spanish in SEXTANTE (except for the string in the software itself). As you can see, this decision affects not only the software, but also other elements such as this blog, which from now on will be written exclusively in english.

Hopefully, someone will help me keep the Spanish help documents (kinda) updated, but if that does not happen, at least we will have good English docs to work with. Of course, still a lot of work has to be done, but somehow I see it easier now to get somewhere, and the task doesn't seem now to me so overwhelming (which, needless to say, encourages me to work more than before)

To help people stay tuned with SEXTANTE, I will also post these entries to the users mailing list. I write just a couple of entries a month, so I guess that it will not be annoying for most of the list subscribers.

Avances

2011-04-01T10:46:00.002+02:00

Aquí van algunas ideas sobre los avances en los que voy trabajando últimamente y los cambios que esto supone en SEXTANTE.

1) He modificado la estructura del SVN. Ahora hay una sola carpeta (un solo proyecto) para todos los algoritmos. Esto implica ademas un solo jar con algoritmos en la distribución. Más fácil de gestionar y mucho más práctico. Voy a mantener las carpetas de los proyectos anteriores durante un tiempo, pero ya no haré cambios sobre ellas en el SVN

2)He añadido una carpeta gvSIG_2 en la carpeta de bindings del SVN. Aunque me falta un poco de trabajo, son ya unos bindings completos para SEXTANTE sobre gvSIG 2.0, que previsiblemente ha de salir pronto. Estos bindings no coinciden con los que el proyecto gvSIG tiene, y que están estructurados de forma distinta y corresponden a una versión anterior de SEXTANTE. Yo he mantenido la misma estructura que en el caso de los bindings anteriores, y el proyecto usa ant como es habitual, en lugar de maven, que es la elección del equipo de gvSIG.

3)He pulido algo los objetos de datos IVectorLayer e IRasterLayer. En el caso de IVectorLayer, he cambiado ademas el comportamiento de los iteradores, más óptimo ahora.

4)La generación de capas raster grandes ya funciona, con independencia de la plataforma. Cuando la capa es muy grande (más que un cierto umbral que estoy pensando sacar fuera como parámetro de configuración de SEXTANTE), SEXTANTE no delega en la aplicación para guardarla, sino que usa su propio sistema en disco y genera después la imagen. Por el momento, solo soporta el formato tif. Este comportamiento se podrá quitar si la aplicación tiene capacidades mayores que estas, pero por el momento creo que es lo mejor, para así poder evitar los fallos que los usuarios tienen con estas capas por falta de memoria.

Nuevas funcionalidades para gvSIG-EIEL

2011-03-15T13:01:00.003+01:00

La Diputación de Pontevedra nos encargó en su momento la realización de algunos algoritmos de análisis nuevos para incorporar a su aplicación para la EIEL (gvSIG-EIEL). Además de añadir estos algoritmos, se creó una interfaz específica para ellos, de forma que se pudieran acceder de manera personalizada y no a través de la caja de herramientas clásica de SEXTANTE y los cuadros de diálogo automáticos que se generan desde esta. No obstante, la base sobre la que se asientan los algoritmos es SEXTANTE, con lo que los éstos pueden emplearse de la forma habitual. Algunos de ellos (los que presentan un interés más genérico), están ya añadidos en el repositorio de SEXTANTE y se publicarán en la próxima versión, entre ellos algunos de gran utilidad tales como los correspondientes a enlaces espaciales de diversos tipos. En posteriores entradas comentaré más al respecto sobre estos algoritmos.

Es de reseñar el apoyo al software libre por parte de la Diputación, y el hecho de que SEXTANTE responde como plataforma a las necesidades de distintos usuarios, que se apoyan en ella para implementar sus formulaciones particulares.

Actualmente la Diputación de Pontevedra ha optado por emplear el proyecto oficial sectorial de la Asociación gvSIG para la gestión de la Encuesta de Infraestructura y Equipamiento Local, denominado gvSIG-EIEL (que supone una evolución de OpenGIS-EIEL), y sobre el que se están incorporando también estas nuevas funcionalidades

Salidas numéricas

2011-02-14T09:25:00.002+01:00

Llevo un tiempo sin escribir en el blog y se me han acumulado las cosas que contar, así que estos días voy a intentar ponerme al día y contar las novedades que he desarrollado últimamente, que no son pocas. Una de las más destacables es la incorporación de resultados numéricos desde un algoritmo de SEXTANTE.

Antes de esto, había algoritmos que generaban resultados numéricos (por ejemplo, estadísticas), aunque estos se presentaban como un resultado de texto, debidamente formateados. Eso permitía al usuario usar esos resultados, pero, al no existir semántico de ellos, no permitía que fuera el programa quien los utilizara para esas cosas. Ahora, al crear un algoritmo, se pueden declarar salidas numéricas que, aunque no se muestran (salvo en un caso particular que ahora veremos), están disponibles para hacer otras cosas con ellas. Esto permite, por ejemplo:

Usar salidas numéricas de un algoritmo como entradas de otro en el modelizador. He añadido ademas un nuevo algoritmo llamado "Calculadora", que permite modificar esos valores mediante operaciones aritméticas, de forma que puede hacerse que un algoritmo tome en uno de sus parámetros el valor de la media de una capa raster elevado al cuadrado, por ejemplo. Estoy en proceso de modificar la calculadora de mapas y la calculadora de campos para que puedan meterse esos valores como parte de las fórmulas.
Mejor estructuración de las salidas en ejecuciones múltiples. Si se ejecuta un algoritmo que genere alguno de esos textos con valores numéricos de forma iterativa, esto puede dar lugar a un número muy elevado de tales resultados, difíciles de aprovechar después. En ese caso, SEXTANTE ahora prepara dichos datos en una tabla, de forma que son más sencillos de analizar y más manejables.

Ejecución iterativa de algoritmos.

2011-02-13T19:11:00.002+01:00

Una novedad que llevará la próxima versión de SEXTANTE (y que ya está disponible en las versiones diarias desde hace algún tiempo e incluso la presenté en las jornadas de gvSIG en diciembre) es la ejecución iterativa de algoritmos. Para todos aquellos algoritmos que toman como entrada alguna capa vectorial, es posible ejecutar dicho algoritmo sobre cada una de las entidades de esa capa. Es decir, que si, por ejemplo, contamos con una capa de polígonos con 10 entidades y ejecutamos el algoritmo "Cortar capa raster con capa de polígonos", al hacerlo iterativamente se ejecutará ese algoritmo 10 veces, tomando cada vez como entrada vectorial una capa que contiene un único polígono. De este modo se generarán 10 nuevas capas raster, automatizándose el proceso notablemente.

Un resultado similar se podría obtener anteriormente separando la capa vectorial en n capas vectoriales de una entidad y después recurriendo al proceso por lotes. Ahora SEXTANTE permite hacer eso en un único paso.

Para acceder a la ejecución iterativa de un algoritmo, basta pinchar sobre su nombre en la caja de herramientas. Aparecerán tantas opciones de ejecución vectorial como parámetros de tipo capa vectorial requiera el algoritmo, ya que no es posible iterar sobre varias capas a la vez, debiendo elegirse una de ellas en caso de que el algoritmo necesite varias.

Para más detalles, puede verse el video de la presentación de gvSIG que he mencionado, que está ya disponible aquí.

Sobre la Ley Sinde, los creadores y otras historias.

2011-01-10T08:40:00.004+01:00

En estos tiempos en que la Ley Sinde está en boca de todos y en buen número de ocasiones para decir bastantes tonterías, quiero aportar mi granito de arena a la discusión desde este blog. Tratándose del blog de un software libre, mi postura al respecto no debiera sorprender a nadie, pero aún así creo que siempre hay formas distintas de matizar o argumentar lo que uno piensa.

La Ley Sinde admite muchas interpretaciones y aquellos que la defienden esgrimen muchos argumentos para justificarla. Sin atreverme a afirmar que todos ellos son incorrectos, hay uno de ellos que considero especialmente falaz y me irrita en particular, y que veo últimamente demasiado a menudo: sin una ley como esta, y dejando el mundo de la creación en las crueles manos de "piratas" y otras gente de similar ralea, la cultura y la creación morirán irremediablemente. Es decir, nos quedaremos sin libros, sin música, sin películas y sin ningún otro producto de la creatividad humana, que, si hacemos caso a quienes así pronostican el Apocalipsis cultural, se encuentra inevitablemente condicionada a la consecución de algún tipo de recompensa o beneficio, a ser posible pecuniario.

Quienes nos pretenden convencer así no son, en mi opinión, verdaderos creadores, y nunca han sentido la verdadera necesidad de crear que lleva animando al ser humano a hacer avanzar las ciencias y las artes (cosas que vienen en realidad a ser una misma) desde el origen de los tiempos. Admito que un señor que escribe programas de ordenador o graba canciones quiera cobrar por cada copia de su obra que se distribuye. No comparto su opinión pero me parece lícito que así lo haga (aunque también me resulta difícil asimilar el agravio comparativo que supone para otras profesiones que no tienen adquirido ese dudoso derecho a cobrar varias veces un trabajo). Admito también que, ante el previsible declive de su negocio, reivindiquen su condición privilegiada en lo que a remuneración se refiere. Sin embargo, no admito que quieran hacernos creer que de no ser así vamos a perder cultura, porque, sencillamente, no es así. Basta mirar un poco la historia para darse cuenta de que es un argumento falaz. Y sobre todo, y esto es lo que más me irrita, es un argumento que desprestigia y mancha la figura del creador, y yo, como creador que soy, reivindico una imagen distinta de aquellos a los que nos gusta ejercitar nuestra creatividad, ya sea que esta produzca líneas de código, versos, imágenes, bustos de bronce o cualquier otra cosa.

Podría hablar de música o de literatura, por ser formas de creación que me gusta también practicar, pero siendo este un blog de SIG hablaré desde la perspectiva de un tipo de creador que parece que no se tiene demasiado en cuenta: el creador científico. Acabo de hacer pública la primer versión de mi libro libre sobre SIG, un proyecto en el que llevo trabajando ya unos cuantos años, y que es únicamente el fruto de mi afición por los SIG y por escribir acerca de ellos. El libro se distribuye bajo una licencia libre, y mi única intención al escribirlo ha sido disfrutar del hecho de hacerlo. Simplemente eso.

¿Me gustaría ganar mucho dinero vendiendo copias de mi libro de la forma habitual? Probablemente sí (aunque siendo realista es muy poco posible que eso suceda...) ¿Sería justo que yo recibiera algún tipo de compensación de cada persona que saque partido a mi libro, y que pudiera obligar a ello antes de conceder derecho para ese uso? Para algunos, probablemente sí. Para mí, sin embargo, no es ningún problema saber que alguien lo usa sin que yo reciba nada a cambio. En cualquier caso, lo que está claro es que el libro está ahí y ha sido creado sin ayuda de ningún tipo y sin que hayan de mediar otros intereses más allá del que la propia creación en sí comporta. Y, aunque esto suene ciertamente petulante (pido perdón por ello de antemano), creo, como profesional y buen conocedor del SIG que soy, que este libro contribuye a la cultura y al ámbito del SIG tanto como las obras de la mayor parte de esos autoproclamados "creadores" lo hacen a la música, el cine o la literatura. El acto de crear en sí, siempre y cuando no existan obstáculos que lo impidan y se dispongan los medios necesarios (no es lo mismo escribir un libro que hacer una escultura cuyos materiales han de pagarse), es lo que verdaderamente anima al auténtico creador.

Niels Henrik Abel gastó su dinero en publicar su más famoso artículo (el de la imposibilidad de resolver las ecuaciones de grado mayor que el quinto mediante radicales) porque creía en él y porque tal vez su pasión por la matemática era la de un verdadero creador y no la de un artistucho interesado. Lo que Abel necesitaba no eran royalties ni que se le pagara por cada científico que sacase partido a sus trabajo. Más bien, necesitaba que alguien hubiera invertido en darle un trabajo que le evitase tener que vivir en una pobreza que le llevo a morir de tuberculosis con solo 27 años. Es un caso un poco extremo, pero curiosamente esa ayuda a la investigación (es decir, a los creadores científicos) que a Abel le hubiese venido tan bien es la que este mismo gobierno que ahora nos quiere colar la Ley Sinde lleva recortando desde hace tiempo. Cuando toca poner dinero en lugar de recaudar, parece ser que los creadores ya no importan tanto.

Lo que vengo a decir es que la cultura y la creación van a seguir ahí pase lo que pase, lo cual no quiere decir que no se deban apoyar económicamente. Sin embargo, si se quiere de verdad potenciarlas, lo que se debe hacer es apoyar a los creadores para que lleven a cabo su labor creadora, de forma que no tengan que lidiar con otros problemas y puedan dedicarse a su arte plenamente. Y esto se consigue con un apoyo "antes" o "durante" la creación. Darles una forma para vivir del cuento una vez que han creado (es decir, "después" de crear) no es una buena manera de apoyarles y, sobre todo, deja fuera a una buena parte de creadores (entre ellos la inmensa mayoría de creadores científicos) que tienen también mucho que aportar.

Una última recomendación, para aquellos que quieran descubrir lo que la autentica pulsión creadora y científica quiere decir (y que probablemente no les vendría mal a muchos de los pro-Sinde): lean "Surely You're Joking, Mr. Feynman!: Adventures of a Curious Character", de Richard Feynman. Cuentan que Newton se metió una vez una aguja por un ojo para simplemente ver qué pasaba. La curiosidad y la inquietud investigadora de Feynman no tienen nada que envidiar a las de Newton, pero son algo menos espeluznantes y, sin duda, infinitamente más divertidas.

JTS 1.11

2011-01-05T11:57:00.002+01:00

En el caso de que alguien haya decidido empezar el año probando alguno de los últimos builds diarios de SEXTANTE, y lo haya hecho con gvSIG, habrá notado que SEXTANTE usa ahora la versión 1.11 de JTS, lo cual causa problemas y no arrancará correctamente el programa. Para solucionar esto, deben sustituirse dos ficheros de la carpeta de gvsig ([directorio de gvSIG]/bin/gvSIG/extensiones/com.iver.cit.gvsig/lib:

- bin/jts-1.9gvSIG.jar

- bin/jtsio-1.8.jar

En su lugar, se deben poner los correspondientes a la versión 1.11, que se han de descargar de la página de JTS, ya que no vienen con SEXTANTE (el primero de ellos sí, porque es necesario, pero el segundo no, ya que SEXTANTE no lo usa. No obstante, parece que algunas clases que están ahora en el primero estaban antes en el segundo, lo cual causa conflictos si no se sustituyen ambos).

Una vez hecho esto, no debería haber más problemas. Como comenté en la entrada anterior, JTS 1.11 trae algunas funcionalidades nuevas, que ya están aprovechadas desde los algoritmos de SEXTANTE correspondientes.

Esta información está incluida en el fichero readme.txt que acompaña a la versión diaria.

Nuevos algoritmos (I)

2010-12-22T09:52:00.002+01:00

Como parte de algunos proyectos que estamos llevando a cabo, hemos desarrollado algoritmos nuevos en SEXTANTE que pueden ser de interés para la comunidad. Aquí cuento algunos de los más destacables que se han añadido últimamente. Aun falta testeo y documentación, pero los encontrareis más o menos operativos en el SVN y la versión diaria.

-Cálculo de ejes de polígonos. Extrae el denominado "medial axis" de un polígono. Útil, por ejemplo, para reducir una carretera expresada como un polígono a una línea.

-Teselación de Voronoi. El dual de la triangulación de Delaunay que ya estaba implementada. Aprovechamos que el algoritmo está en la última versión de JTS (1.11), en la que ahora nos apoyamos (escribiré en breve algo más sobre esto). También he modificado el algoritmo de esa triangulación para que sea la propia JTS quien lo haga, en lugar de una clase externa contribuida por un colaborador.

-Disolver múltiple. La disolución de polígonos ahora se puede efectuar en base a varios campos, no solo uno de ellos.

-Buffer múltiple. Un buffer con anillos de diferentes tamaños, que se introducen mediante una pequeña tabla.

-Localización óptima con tabla de distancias. Las distancias, en lugar de calcularse como distancias euclídeas o de Manhattan, se incorporan mediante una tabla, permitiendo así que reflejen distancias a través de una red. Las funcionalidades de análisis de redes de gvSIG pueden emplearse para generar las tablas correspondientes. Este algoritmo ha surgido a raíz de un capítulo sobre SEXTANTE que voy a escribir para un libro sobre localización óptima que Joaquín Bosque está editando, y esta es solo una pequeña ampliación que nos ha parecido buena idea hacer.

Reclutando

2010-12-21T11:23:00.002+01:00

Tanto el propio proyecto SEXTANTE como otros proyectos que llevamos, también relacionados con análisis de datos espaciales, y en particular con datos 3D y análisis 3D, están creciendo últimamente bastante. Esta gran noticia nos lleva a la necesidad de buscar nuevos colaboradores que trabajen con nosotros y que puedan integrarse en nuestro equipo.

Actualmente, estamos ofertando un puesto de trabajo para un programador Java, preferiblemente con conocimientos de SIG y análisis espacial, para trabajar aquí en la Universidad. Todos aquellos interesados pueden ponerse en contacto con nosotros enviando un email a volaya ARROBA unex PUNTO es. La oferta se ha publicado también por otros medios, pero seguro que entre los lectores del blog puede haber algún candidato, o bien alguien que puede difundir el anuncio.

Jornadas gvSIG

2010-12-09T09:36:00.002+01:00

Algunos apuntes rápidos sobre las Jornadas de gvSIG:

Es probable que nos traigamos algunos proyectos interesantes que intentaremos poner en marcha lo antes posible. Entre ellos, la integración de procesos de R en SEXTANTE. Iré informando por aquí a medida que vayamos avanzando.
El taller de SEXTANTE fue perfecto. Llegué apurado de tiempo a una sala llena hasta arriba, pero todo lo demás fue sobre ruedas y me divertí como nunca. Espero que la gente disfrutara tanto como yo y no se aburriera con algunas de mis locuras de geo-flipado.
Estamos perfilando cursos de SEXTANTE para darle un empujón a la actividad docente sobre el programa. Tuvimos algunas reuniones en las Jornadas, y esperemos que a partir de este punto podamos ponernos ya en marcha para organizar cursos frecuentes.
Aunque Manuel Madrid tenia intención de usar música mía para la clausura, al final no tuvo tiempo de hacerlo. Pese a ello, Jorge Sanz dijo que la música sí que era mía, convencido de ello. Por si acaso, aclaro que no lo era. El que tenga curiosidad, puede echar un ojo a volaya.es para escuchar algunas de mis canciones.

gvSIG Code Sprint

2010-11-30T16:14:00.003+01:00

Aquí va una entrada desde el Code Sprint que precede a las Jornadas de gvSIG, y donde estamos unos cuantos tratando de solucionar problemas y mejorar funcionalidades para ir calentando motores. Yo, como es de esperar, estoy trabajando en cosas relacionadas con SEXTANTE, entre las que cabe mencionar las siguientes:

Problemas con la representación de ciertas capas generadas por SEXTANTE. Esto afectaba a las máscaras y ya hemos detectado la razón. Al parecer, gvSIG asume que toda capa de tipo BYTE es una banda de una imagen RGB, y establece la representación en función de ello. Esto no es siempre cierto, y SEXTANTE genera capas BYTE en muchas situaciones distintas a esa. Hemos encontrado una solución rápida pero eficaz, así que ya hemos aportado una mejor directa a gvSIG :-)
Capas ráster grandes. Hemos aclarado un par de cosas, y creo que tengo una buena línea de trabajo ahí... Lógicamente, esto no lo voy a acabar hoy, pero voy enfocando el problema cada vez mejor y creo que puede verse una solución pronto...
Análisis de capas WMS. Más difícil de lo que parece, así que por ahora estamos pensando y reflexionando más que otra cosa. Aun así, el jueves haré un ejemplo de WMS y SEXTANTE, para ir abriendo boca...

Más noticias en breve, sobre todo el jueves después de mi taller, que esta vez es algo diferente a otros que he hecho, y en el que enseñaré algunas cosas nuevas.

Región de análisis

2010-11-15T09:52:00.002+01:00

La funcionalidad de "Salida ráster" que permitía, en caso de que un algoritmo generara algún resultado de tipo ráster, definir las características de este (tamaño de celda y extensión), se aplica ahora a todo tipo de resultados. Algo similar al concepto de región de análisis de GRASS, pero en este caso establecido en cada ejecución del algoritmo en lugar de para toda la sesión de trabajo de forma global.

Lógicamente, el tamaño de celda no es necesario para el caso de capas vectoriales. La región no es necesariamente la de salida de los datos, sino que el algoritmo puede emplearla como considere más oportuno. Por ejemplo, para el caso de interpolación, el establecer una región puede ser empleado para los datos de salida, pero en los de entrada se puede coger un margen más amplio para incluir más datos. En otros casos, se usa como filtro para los datos de entrada, y luego es el propio algoritmo el que marca la extensión de los datos de salida (por ejemplo, si se efectúa una traslación).

He adaptado ligeramente algunos algoritmos (sobre todo vectoriales) para que hagan uso de esta nueva capacidad de SEXTANTE. Por ejemplo, los algoritmos de generar una rejilla o una capa aleatoria requerían antes la entrada de cuatro valores para establecer las dos coordenadas de las esquinas opuestas del rectángulo de salida deseado. Ahora esos valores se toman de la región de análisis.

Aprovecho esta entrada para comentar que esta funcionalidad, junto con otra más novedosa sobre la que escribiré aquí en un par de días, las presentaré dentro del taller de SEXTANTE que realizaré en las jornadas de gvSIG de este año, el 2 de diciembre. Es decir, que el taller contendrá novedades...y alguna que otra sorpresa que seguro que gusta ;-) Ya sabéis, nada de perdérselo...

Una solución para el problema de los rasters grandes

2010-10-15T10:45:00.002+02:00

Como muchos ya sabéis, SEXTANTE no hace gestión de datos (lectura, escritura y creación de capas) por sí mismo, sino que delega en la aplicación que tiene debajo para estas tareas. Esto quiere decir que, por ejemplo, si se va a crear una capa raster de gran tamaño, SEXTANTE no la crea, sino que se la pide al SIG que tiene debajo y después la rellena de valores, y es el SIG quien luego se encarga de guardarla en el fichero correspondiente.

Como muchos ya sabréis, esto también significa que, si el SIG no es capaz de hacer estas cosas eficientemente, el uso de este tipo de funcionalidades en SEXTANTE no va a salir bien. El problema es que, por el momento, esto no parece estar solucionado en los SIG que usan SEXTANTE, así que se presentan frecuentemente problemas de memoria.

En el caso de gvSIG, se ha hecho algo para manejo de grandes capas en escritura, pero la solución está por mejorarse para contemplar más casos posibles (los algoritmos de SEXTANTE tienen una casuística variada en lo que al acceso en escritura respecta), y por el momento no se está usando desde SEXTANTE. Existe, asimismo, el problema en lectura, en el que espero un día de estos poder ponerme a trabajar junto a la gente de gvSIG para solucionarlo.

Intentando dar una solución genérica a esto, he empezado a pensar en una alternativa en la que, saltándome un poco la arquitectura independiente de SEXTANTE, sea el propio SEXTANTE quien escriba los datos y los gestione cuando estos son muy voluminosos. Para ello estoy usando una librería que permite imágenes tileadas con caché en disco, de forma que, combinada con JAI, me permitiría hacer yo mismo todo eso. Despues, cuando SEXTANTE le pida a la InputFactory correspondiente una capa raster, si esta es grande, devuelva una de estas imágenes tileadas.

No sé muy bien como va a quedar esto, pero es interesante probar. Obviamente, el rendimiento será peor, pero si funciona, va a permitir crear capas de gran tamaño sin los problemas actuales.

Iré contando por aquí como va la cosa.

Artículo OSGeo Journal

2010-09-27T09:26:00.002+02:00

Después de mucho tiempo, por fin está listo el número del OSGeo Journal en el que aparece un artículo que escribí sobre SEXTANTE. Se trata de una presentación general del proyecto y de la librería y sus componentes. Los interesados lo podéis descargar de la siguiente dirección:

http://svn.osgeo.org/osgeo/journal/volume_6/en-us/OSGeoJournal_vol6.pdf

A ver si esto nos va dando más popularidad por ahí fuera. Creo que llega en un buen momento, justo después del FOSS4G. Veremos a ver.

FOSS4G Barcelona

2010-09-14T10:56:00.003+02:00

Aquí van mis impresiones sobre el FOSS4G de Barcelona, donde estuve la semana pasada compartiendo experiencias con la comunidad del SIG libre.

La organización fue buena en lo que al aspecto científico se refiere, pero algo menos en lo que respecta al social. Sin ánimo de criticar demasiado, la falta de un cocktail de bienvenida (el clásico "icebreaker cocktail" que en todos los demás FOSS4G se hace) o similar me pareció un grave error. ¿Por qué? Pues porque al final del primer día todo el mundo se va a tomar cañas, pero meter a 900 tíos en un mismo sitio es básicamente imposible, con lo que acabas con los 10 conocidos de siempre y no haces contactos nuevos. Poniendo un sitio con algo que picar y que beber donde pueda estar todo el mundo, se promueve el intercambio de ideas y conversaciones mucho más que con ninguna otra actividad. Como no todo van a ser críticas en este sentido, debo decir que la colocación de mesas y enchufes por todo el edificio fue un enorme acierto (sobre todo ahora que mi portátil está ya viejuno y no le duran las pilas más de una hora)
No fui a muchas charlas, pero el nivel me pareció algo más flojo que otros años. Me pareció que estaban menos elaboradas, aunque, afortunadamente, sigue habiendo buenas ideas y desarrollos interesantes.
Como dijo alguien, el congreso me ha hecho ver que SEXTANTE goza de buena salud, ya que hay interés y gente con proyectos de incorporar SEXTANTE de uno u otro modo a su trabajo, además de aquellos que ya lo usan. Se vio mucho WPS, y creo que el año que viene va a ser algo todavía más presente, por lo que durante este año tengo que trabajar duro para colocarlo en la medida de lo posible en los servidores y para que el cliente sea todavía más operativo. Sigo pensando que ahí hay mucho futuro y que SEXTANTE está en una posición muy buena para jugar un papel importante en este campo.
Hubo buena acogida de la charla sobre la integración de GRASS y SEXTANTE, con Markus Neteler y Helena Mitasova entre el público. Lo ejecuté sobre linux y la verdad es que el funcionamiento es intachable. Una pena que Benjamin Ducke, autor de parte del código, no pudiera estar allí y dar parte de la charla conmigo.

Productividad

2010-07-27T09:10:00.003+02:00

Un par de semanas antes de irme de vacaciones (en teoría sigo en ellas, aunque este año no me he ido lejos, y con el ordenador cerca es difícil resistirse a programar...) empecé a buscar nuevas fórmulas para intentar mejorar la productividad en mi trabajo. Los resultados y conclusiones a los que he llegado son peculiares, y los pongo aquí para que compartirlos con quien pueda estar interesado. No se ha de olvidar, no obstante, que yo soy un programador, no un usuario de SIG como probablemente una buena parte de los lectores de este blog, aunque de cualquier modo creo que estas ideas pueden ser interesantes para todos.

La idea fundamental en la que he basado mis mejoras (que creo que funcionan notablemente) es la siguiente: el problema que reside detrás de la pérdida de productividad (al menos en mi caso), no es hacer las cosas lentamente, sino perder la concentración y no mantener un flujo de trabajo constante. En otras palabras, las soluciones que uno puede encontrar que automatizan procesos y proporcionan atajos para realizar diversas tareas añaden algo más de productividad, pero esta es en realidad muy poca, y a veces incluso se pierde por otras consecuencias negativas asociadas. Tratándose de un trabajo muy concreto y que se realiza con una única herramienta (el 99% de mi trabajo en SEXTANTE se hace única y exclusivamente usando Eclipse), es mucho más útil tratar de mantener de un modo u otro la concentración en esa herramienta, evitando las distracciones y el uso (sea para lo que sea) de cualquier otra.

Como consecuencia de esto, he modificado mi sistema con algunas de acciones que pueden parecer poco lógicas, pero que me están permitiendo rendir más, al menos en lo que a SEXTANTE y a la programación respecta. Son las siguientes:

* Mi ordenador es difícil de usar: Todas las cosas que antes hacía con suma facilidad, ahora cuestan algo más. Por ejemplo, mi menú de inicio no tiene ahora ningún acceso directo a ninguna aplicación, y mi variable de entorno PATH está prácticamente vacía, así que para lanzar cualquier aplicación tengo que ir a la línea de comandos, llegar hasta el directorio donde está instalada y ejecutarla. Suficiente tedio como para que no me apetezca lanzar chrome cada vez que me viene a la cabeza el nombre de un tío que toca el saxofón y quiero saber en que día nació, o chorradas similares. Mi correo lo leo muchas menos veces, y pierdo mucho menos tiempo.

Por supuesto, esto quita productividad si tengo que estar cambiando de aplicaciones y abriendo una tras otra, pero como digo, rara es la vez en que tengo que hacer eso. Lo que hago normalmente es sentarme delante de Eclipse y escribir código. Punto.

Para limitar más aún las ganas de tener muchas aplicaciones abiertas y utilizarlas a la vez pasando de una a otra, he desactivado el Alt+Tab. Para cambiar entre aplicaciones, tengo que lanzar el administrador de tareas, y ahí ir a la aplicación que quiera dentro de la lista de las disponibles. Estaréis pensando que también puedo hacerlo con el ratón, pero no, porque

*No tengo ratón. No es que lo use poco, es que directamente no hay. Como estoy en el portatil, he desactivado el touchpad. De hecho, para evitar tentaciones de activarlo dándole al botón (demasiado fácil), he desinstalado el driver de synaptics. Esto tiene dos consecuencias principales: por un lado, todos sabemos que las teclas son mas rápidas, pero el ratón es una comodidad que saca nuestro lado más vago. Ahora, cuando estoy en Eclipse, soy más productivo porque tan solo puedo hacer las cosas con teclas. Por otra parte, es más engorroso hacer otro tipo de cosas, como por ejemplo caer en todas esas miles de distracciones que Internet (el verdadero agujero negro de productividad...) ofrece.

Me he instalado una extensión para chrome (gleeBox) que permite navegar fluidamente sólo con teclas, y activando los atajos de teclado GMail se maneja sin problemas (salvo para borrar mensajes, que hay que remapear una tecla por un fallo en chrome). Pero si, después de superar el engorro de lanzar el navegador, me apetece cotillear en Facebook, ir a alguna página de videos o, especialmente, entrar en algo que use flash...entonces la cosa es algo más farragosa, así que no suelo hacerlo. Las páginas web que uso para algo profesional (consultar algo sobre Java, leer un blog sobre GIS, etc) son sencillas y se accede a ellas casi más rápido con teclas que con ratón. Las que no son de ese tipo y tienen mas distracciones que otra cosa, generalmente no están muy pensadas para usarse sin ratón.

En resumen, tengo un ordenador que va muy bien para usar una cosa a la vez (como digo, casi siempre Eclipse, aunque también mejora el uso de mi entorno de LaTeX, por ejemplo), ya que te fuerza a concentrarte realmente en eso que estás haciendo. Esto lo estoy aplicando en mi portátil, aunque cuando vuelva al ordenador de sobremesa lo aplicaré igual. Y estoy pensando en quitar el segundo monitor, que, a pesar de que he sido un ferviente defensor de él (al igual que muchos otros programadores), empiezo a pensar que permite tener muchas distracciones a la vista. Con una pantalla de 22 pulgadas panorámica puesta en vertical (ideal para leer mucho código) como la que tengo ahora como monitor principal, creo que es suficiente para trabajar a pleno rendimiento.

Por si alguno está pensando "y si alguna vez quieres divertirte y hacer otras cosas con el ordenador, ¿qué haces?", la respuesta es sencilla. Cuando quiero divertirme, o bien programo(¡y ademas ahora es más divertido, porque programo más!)...o bien me alejo del ordenador y me voy de cañas con los colegas, que es mucho mejor que andar haciendo el tonto mirando webs sin sentido :-)

Feliz verano a todos!

Anticipo SEXTANTE v0.6

2010-06-23T10:22:00.003+02:00

Todo esta más o menos listo para sacar la próxima version de SEXTANTE, que será la 0.6. Aquí van algunas de las cosas que incluye.

Menos módulos: Sí, este SEXTANTE trae menos cosas y menos algoritmos. Hemos eliminado algunos paquetes procedentes de contribuciones externas, ya que no hemos podido testearlos lo suficiente y hemos constatado que su uso no estaba muy extendido, así que preferimos esperar a que sean más estables. Algunos de ellos tienen bugs o comportamientos extraños y, como era predecible, sus correspondientes autores andan ocupados y no pueden dedicarles tiempo a las correcciones, por lo que no hemos podido estabilizarlos. Buscando tener un SEXTANTE lo más estable posible, hemos optado por retirar todos esos algoritmos por el momento, aunque esperamos recuperarlos para futuras versiones.
Integración GRASS completa. Hemos contado con la ayuda de Benjamin Ducke, de Oxford Archaeology, quien ha hecho un increible trabajo puliendo la interfaz y testeando casi individualmente que los modulos de GRASS funcionen correctamente desde SEXTANTE, tanto en Mac como Linunx como Windows.
Mejores traducciones. Tambien con la ayuda de Benjamin Ducke, la traducción al inglés ahora es más precisa.
Cambios internos que facilitan la integración y la labor de otros programadores. Esta última etapa de desarrollo de SEXTANTE ha sido muy intensa en cuanto a colaboraciones con otros proyectos, así que hemos hecho mucho para facilitar su labor e incorporar ideas.
Menos bugs ;-)
Nueva licencia. No es definitivo, pero es probable que esta versión salga con licencia MIT. Hemos iniciado una ronda de contactos con la gente que ha contribuido código, con objeto de tener su permiso para hacer este cambio, y casi todos han respondido ya favorablemente. Nuestra intención era realizar este cambio más adelante, en otra version posterior, per viendo que es posible hacerlo ahora, es de prever que la version 0.6 de SEXTNATE se distribuya bajo licencia MIT

Mini Jornadas Trabajo SEXTANTE

2010-06-02T09:02:00.002+02:00

Al final, las anunciadas Sesiones de Trabajo de SEXTANTE, previstas para hace un par de semanas, no pudieron llevarse a cabo porque falló gran parte de la gente, pero conseguimos sacar adelante un pequeño pero productivo encuentro entre algunos de los que sí pasaron por aquí. Durante tres días estuvimos reunidos aquí con Nacho Brodín (Prodevelop), Nacho Varela (Cartolab Coruña) y Ruth Schonenbucher (CSGIS, Alemania). Trabajamos principalmente en la integración de gvSIG 2.0 y SEXTANTE, en pulir bugs y pequeños fallos de SEXTANTE y en preparar materiales para un módulo de UNIGIS sobre SEXTANTE. Completamos la mayor parte de lo que teníamos pensado hacer, así que podemos decir sin lugar a dudas que nuestra reunión fue un éxito rotundo.

Algunos cambios que se han hecho en el núcleo de SEXTANTE para la integración con gvSIG son de interés para todos los usuarios de SEXTANTE, en especial lo relativo a paneles de parámetros. Ahora la ventana de parámetros por defecto (la que crea SEXTANTE automáticamente al ejecutar cada algoritmo para rellenar los datos que necesita) es configurable en función de la aplicación. Esto permitira, sobre todo, que gvSIG no ofrezca sólo la opción de seleccionar un fichero de salida, sino tambien otro tipo de "destino" para los datos resultantes, como puede ser una base de datos o cualquier otro soportado por su arquitectura de datos.

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En resumen, días productivos y muy divertidos que esperemos que se repitan pronto.

Manual uDig/SEXTANTE

2010-05-10T11:14:00.002+02:00

Hace ya tiempo que comenzamos timidamente a integrar SEXTANTE en uDig. El problema es que yo no tengo mucha idea de cómo funciona uDig y de cómo se desarrollan aplicaciones con SWT, así que mi capacidad era bastante limitada y lo único que pude hacer fue ayudar a Jesse Eichar, cabeza del equipo de desarrollo de uDig, para que él integrará SEXTANTE con vistas a tenerlo incorporado en una próxima versión. Aunque se hizo bastante trabajo, la cosa quedó parada y no hay novedades desde hace mucho, pero parece que las cosas puden volver a ponerse en marcha.

La gente de Axios, empresa española que trabaja con uDig y desarrolla sobre el programa, ha publicado un interesante manual titulado "Reutilizando procesos espaciales existentes. Integrando SEXTANTE", en el que explican la programación de extensiones de análisis para uDig y cómo aprovechar los algoritmos de SEXTANTE para ello. Yo por mi parte voy a echarle un vistazo con detalle, a ver si me empiezo a enterar de algo más acerca de la mecánica interna de uDig y puedo contribuir a la integración plnea de SEXTANTE en uDig. Para todo el que esté interesado, el manual se puede descargar en la sección de documentos de la web de la empresa, en la siguiente dirección:

http://www.ntclick.com/web/axios/frmManuales.aspx

Twitter y SEXTANTE

2010-04-22T13:59:00.002+02:00

A Manuel de la Calle se le ha ocurrido la idea de hacer un cliente de Twitter (y en el futuro tambien de otras redes sociales) montado sobre WorldWind. La idea, a la que llama GeoSocial, no es del todo nueva, ya que hay muchos mashups por ahí que recogen información de Twitter y la ponen en algun tipo de mapa, e incluso una de ellas (Twittearth) que lo hace en 3D, pero usar un globo 3D en un escritorio es un paso más y surgen nuevas posibilidades. A mi se me había ocurrido usar su desarrollo para montar ese cliente de Twitter sobre el globo 3D con capacidades de análisis que venimos desarrollando últimamente (y al que llamamos S3XTANTE), de forma que una vez recuperados los datos se puedan analizar con SEXTANTE. Esto abre posibilidades para hacer un geo data mining interesante contra toda la información que Twitter acumula, y aunque hay muchas aplicaciones y sitios que analizan de mil formas distinas los datos de Twitter, no he encontrado nada que use la parte geográfica y haga análisis serios con ella. Es decir, que la cosa es más o menos novedosa.

Como me estoy divirtiendo mucho con esto (aunque no le estoy dedicando demasiado tiempo...), le ando dando vueltas y me he dado cuenta de que hay una forma mejor de hacer esto: meter el cliente de Twitter directamente en SEXTANTE. En el fondo, cumple con lo que tiene que tener un algoritmode SEXTANTE, ya que tiene unos parámetros de entrada (los de la conexión a la API de Twitter), y general una capa de salida (de puntos, con los tweets localizados). Dicho y hecho. Ahora cualquier aplicación que tenga SEXTANTE incorporado puede usarse para llamar a la API de Twitter, recoger datos y crear con ellos una capa, que despues puede ser analizada como uno quiera con el resto de algoritmos.

Por el momento solo hay un algoritmo que hace una busqueda genérica, igual que si la hicieramos desde la página de busqueda que Twitter ofrece. A ver si hago otro en el que puedas autenticarte con tu usuario y ver cosas de la gente a la que sigues, y otros inventos similares. Más noticias en breve.

Software libre junto a software propietario

2010-03-11T10:31:00.002+01:00

Se ha mencionado alguna que otra vez en este blog la intención que tenemos (o al menos hemos pensado en ello alguna vez) de hacer que SEXTANTE pueda ejecutarse desde aplicaciones propietarias, desarrollando los bindings correspondientes igual que ya hemos hecho (o han hecho otros) con aplicaciones libres. Esto ha desatado discusiones y comentarios más o menos "intensos", y ha hecho aparecer algo de división entre aquellos con los que hemos comentado esta idea.

Estoy ahora en la presentación que abre las Jornadas de SIG libre de Girona, a cargo de Agustín Lobo, y como ejemplo de software open source exitoso menciona a R. Uno de los síntomas de ese éxito es, según él, que exista software propietario que enlaza con R. Y en otra transparencia mencioa explicitamente al enlace entre R y ArcGIS

¿Qué pensais de ésto? ¿Estáis en el lado de Agustín (y nuestro), o pensáis que más que un éxito es un mal síntoma y algo contraproducente para el software libre?

Para que quede más claro, repito que esto es para nosotros sólo una idea, y que no vamos a ponerla en práctica por el momento, ya que hay otras tareas que consideramos más importantes, pero eso no implica que no esté ahí y nos resulte interesante.

Nuevos algoritmos de visibilidad

2010-02-11T08:58:00.002+01:00

Algunas colaboraciones externas aportan a SEXTANTE nuevas funcionalidades que no existían. Otras, por el contrario, mejoran lo que ya tenemos, haciéndolo más robusto o eficiente. El trabajo de Aviad Segev (Israel) está en este segundo grupo, ya que ha implementado unos algoritmos de aproximación para cuencas visuales que mejoran enormemente el tiempo de proceso de los antiguos algoritmos de SEXTANTE gracias a una optimización que disminuye sensiblemente el volumen de calculos necesarios a realizar. Hay dos algoritmos: el primero de ellos emplea un 3% de tiempo de proceso del algoritmo original de SEXTANTE con un 98% de precisión, mientras que el segundo emplea sobre el 0.4% del tiempo y tiene una precision media del 95% (datos aportados por el autor, todavía no comprobados por mí de forma rigurosa...)

Para quien quiera saber más, el artículo en el que se describen estos nuevos algoritmos está en este enlace.:

Approximating the visible region of a point on a terrain' by B. Ben-Moshe, P. Carmi, and M.J. Katz (http://cg.scs.carleton.ca/~paz/papers/radar5-1-04.pdf)

Y por supuesto, se puede mirar el código en el SVN de SEXTANTE, que contiene abundantes comentarios.

Reseña OSOR

2010-02-04T15:04:00.002+01:00

Y vamos con un poco de autobombo... Ahí os dejo otro articulito de la gente de OSOR, comentando que ya son mas de 2000 los programas que albergan, y con un enlace a nosotros y menciones como:

"The three most popular projects that are hosted on OSOR itself are Sextante, geospatial analysis software, Wollmux, which add office template functionality to OpenOffice and GvSig, software to manage, analyse and use geographic information."

Para el que quiera leerlo entero:

http://www.osor.eu/news/two-thousand-open-source-applications-for-the-public-sector

Nueva política de distribución

2010-02-04T10:46:00.003+01:00

Tras pensarlo detenidamente (es una decisión importante y con consecuencias notables), hemos decidido cambiar la forma de distribuir SEXTANTE a partir de la siguiente versión (a publicar en un mes más o menos). La razón principal es que cada vez resulta mas complejo el mantenimiento de las versiones y de las distintas modalidades (un instalador con ayuda en español, otro en inglés, uno para gvSIG, otro para OpenJump...). Además, para rematarlo, la versión 0.5 tiene problemas para ejecutarse en gvSIG, ya que algunos algoritmos requieren java 1.6, mientras que éste va con 1.5. Para evitar todos estos problemas hemos decidido comportarnos como lo que realmente somos: una librería. A partir de ahora enfocaremos nuestro trabajo a los desarrolladores y distribuiremos un zip con todo SEXTANTE (núcleo, algoritmos, bindings varios, ayuda...), y serán los responsables de aplicaciones los que serán responsables de incorporar SEXTANTE en éstas si así lo desean, de la misma forma que ahora emplean otras librerías como JTS, Log4J, etc.

Una gran parte de los usuarios de SEXTANTE ya lo hacen así (por ejemplo, 52N o GearScape), sin necesidad de que nosotros tengamos que publicar versiones específicas para sus usuarios. Son ellos los que piensan en sus usuarios y se apoyan en SEXTANTE para darles más funcionalidad. Las restantes aplicaciones esperemos que se adapten a nuestra nueva filosofía, y estamos en contacto con ellos para que así sea, por supuesto dispuestos a echar una mano en lo que sea necesario. Creemos que a largo plazo esto será mejor para todos, y sin duda repercutirá en un mejor producto.

Aunque anunció esto ahora por aquí como un anticipo, es probable que esta noticia haya que reproducirla en listas y similares más adelante, ya que cuando se publique la nueva versión de SEXTANTE habrá un aluvión de preguntas del tipo "¿y dónde esta la version para gvSIG?" o "¿y cómo instalo ahora SEXTANTE en OpenJUMP". Esperemos que la comunidad también preste ayuda para este cambio y sigamos trabajando como hasta ahora, o mejor aún.

Integración con GearScape, traducciones y más

2010-02-01T11:01:00.005+01:00

Hace dos semanas organizamos una pequeña reunión familiar de 3 días entre Nacho Varela (Cartolab, SEXTANTE), Fernando González (GearScape) y yo, trabajando intensamente sobre algunos aspectos de SEXTANTE y, sobre todo, compartiendo un tiempo muy productivo y muy divertido que ha todos nos ha dejado muy buen recuerdo y esperamos repetir pronto. Como este blog es (o intenta ser...) serio y basado en SEXTANTE, me ahorraré comentar las cosas divertidas que hicimos mientras no trabajábamos, y me centraré en los avances que hemos hecho, que son sólo dos principalmente, aunque bien es cierto dos muy importantes:

1) Todas las claves de traducción de SEXTANTE han sido traducidas al inglés. Eso quiere decir que ahora en el código solo hay texto en inglés, y desarrolladores que no hablen español pueden entenderlo sin problemas. Nacho trabajó en un script para automatizar esto, y el resultado es perfecto.

2) GearScape ya ejecuta en su consola y con su SQL extendido una buena parte de algoritmos de SEXTANTE. Una descripción más detallada la estamos preparando para el articulo de la presentación que haremos en Girona Fernando y yo, y que creo que va a ser de gran interés. Para que veais en directo lo novedoso que esto es, y echéis un vistazo al fantástico aspecto de GearScape, ahí os dejo un par de gifs animados que lo muestran

En resumen, tres días fantásticos que ojalá podamos repetir pronto. Gracias a Fernando y Nacho por haber pasado estos días aquí. Con gente así, da gusto trabajar (y hacer otras cosas, más todavía).

p.d: Para el que tenga interés en saber a qué dedicamos nuestro tiempo libre, no puedo resistir la tentación de hablar de la fiesta de Jarramplas, en Piornal, a la que acudimos la tarde del miércoles para ver como una horda de paisanos enfervorecidos se dedica a tirarle nabos a otro paisano del pueblo durante casi una hora. Viendo la mala leche con la que Nacho disparaba nabos del tamaño de una cabeza, creo que puedo decir que programar genera algo de tensión :-P Para los que no se imaginen de qué va la cosa, dejo un enlace a un video:

http://www.youtube.com/watch?v=ypNNPVEadi0

Video Jornadas gvSIG

2010-01-25T14:24:00.003+01:00

Este año no he hecho comentario en el blog sobre las jornadas de gvSIG (falta de tiempo, y ahora creo que ya queda demasiado atrás como para hcerlo), pero para los que no pudisteis estar y quereis saber qué contamos de SEXTANTE por esas tierras, aquí os dejo el enlace al video que la organización ha puesto de la charla que yo di.

http://www.viddler.com/explore/gvsig/videos/77

Un magnífico trabajo, sin duda (el que hacen ellos poniendo el video, por supuesto, no el que yo hago en la charla, que es más cuestionable :-P )

Reestructuración SVN

2010-01-15T15:55:00.002+01:00

Un aviso breve para todos aquellos que usan el SVN de SEXTANTE. Hemos cambiado su estructura y ahora los niveles superiores son trunk, branches y tags. La versión más actual la encontrareis ahora en trunk, mientras que en tags tenemos por el momento una única etiqueta, que corresponde a la version 0.5 recién publicada. Esto encaja un poco mejor con la estructura más habitual de un repositorio SVN, y esperemos que ayude a hacerlo más útil.

Recubriendo gvSIG

2010-01-04T09:47:00.001+01:00

Aunque el desarrollo sobre el que trata esta entrada es algo que añadí antes de Navidad, no he tenido tiempo antes para anunciarlo y ahora es un buen momento para hacerlo, para empezar el año con fuerza. Como mucha gente ya ha comentado, sería buena idea poder aglutinar todos los geoprocesos que tiene gvSIG (geoprocesos vectoriales, análisis ráster, redes...), así como los aportados por SEXTANTE, dentro de un marco único que dé una cierta homogeneidad y haga más fácil la vida al usuario. Siendo SEXTANTE un marco de geoprocesos más elaborado que los otros existentes en gvSIG (no en vano, SEXTANTE es sólo eso, un entorno para desarrollar geoprocesos), y disponiendo de herramientas de productividad que no presentan estos (modelizador, etc), parece lógico que sea SEXTANTE el que defina las características de ese marco final bajo el que han de llamarse todos los procesos de análisis. Desde el punto de vista técnico, la cosa no es trivial, pero tampoco es excesivamente compleja, y no requeriría un trabajo excesivo (máxime considerando que podemos trabajar conjuntamente los equipos de SEXTANTE y gvSIG).

Hasta aquí todo bien. El problema no viene, sin embargo, por la parte técnica, sino por la organizativa, y es que no debemos olvidar que un software tiene programadores detrás, pero tambien gente que coordina, organiza, etc., en especial si se trata de un proyecto grande como gvSIG. Y es a nivel organizativo donde no acabamos de encontrar todo el entendimiento necesario, y tras varios intentos de poner nuestro trabajo en común seguimos sin avanzar mucho. Es facilmente comprensible si se considera que todos esos otros geoprocesos de gvSIG han sido financiados por gvSIG, desarrollados por equipos distintos, y cada uno de ellos posee una identidad que en cierta medida se perdería tras una supuesta integración. Es dificil de entender si se piensa en las muchas ventajas que traería la integración, como bien nos han hecho saber a lo largo de este tiempo muchos usuarios. Sea como fuere, la cosa anda algo estancada y no parece que vaya a avanzar mucho, así que desde el lado de SEXTANTE hemos tomado una decisión salomónica: integrarlo todo nosotros, de forma que pueda accederse a todos los algoritmos de gvSIG desde SEXTANTE.

Los aspectos técnicos son similares a la integración de GRASS o la de procesos remotos WPS. El algoritmo SEXTANTE actúa únicamente como un recubrimiento, recogiendo las entradas del usuario y gestionando las salidas, dejando el proceso al algoritmos de gvSIG, que es llamado de forma transparente y puede por tanto incorporarse en los elementos de SEXTANTE como el modelizador o el proceso por lotes. Éstos algoritmos, sin embargo, no pueden ya correr sobre cualquier SIG, sino sólo sobre gvSIG, así que he abierto una nueva carpeta en el SVN llamada app-specific, donde se guardan algoritmos exclusivos para una otra aplicación, a diferencia de los restantes de la librería, que corren sobre cualquier SIG y son independientes. Por el momento solo hay para gvSIG, pero pudiera ser que existiera algo similar en un futuro para alguna otra aplicación.

Para los curiosos, únicamente existe por ahora un algoritmo de reproyecciones, que hace uso de las librerias de gvSIG para estas tareas, y gracias al cual se puede ya, por ejemplo, reproyectar todo un directorio lleno de capas o incluir una reproyección como parte de un modelo complejo. El trabajo para hacer ese algoritmo ha sido más bien poco, así que auguro que, siguiendo a un ritmo similar, en breve podrán encontrarse en SEXTANTE todos los algoritmos de análisis de gvSIG, teniendo además en cuenta que una buena parte de ellos ya está en SEXTANTE (replicados, con la consiguiente duplicidad de esfuerzos que ello implica, aunque eso ya es motivo de otra entrada...).

¿A dónde nos lleva todo esto? Pues en principio hay que ver cómo vamos a gestionar SEXTANTE para gvSIG una vez que SEXTANTE sea capaz de hacer todo lo que gvSIG hace en términos de análisis. La opción 1 es seguir como hasta ahora, con SEXTANTE en gvSIG y con los geoprocesos y demás elementos de gvSIG también ahí, aunque no sean estrictamente necesarios ya puesto que SEXTANTE ofrece todo lo necesario. La opción 2 es darle algo más de homogeneidad y coherencia y dejar esas extensiones de gvSIG por debajo (son necesarias porque son las que procesan) pero desactivarlas de cara al usuario. Es fácil de hacer, y el usuario sólo vería SEXTANTE una vez que lo instale, no el resto de elementos de análisis de gvSIG ni sus interfaces. La opción 3 que consideramos pasa por crear nuestra propia distribución de gvSIG pensada para el análisis, que incluya lo del paso 2 más modificaciones extras que nos interesan y echamos de menos en gvSIG, así como, por ejemplo, una maquina virtual propia (como la distribución para Windows Vista, de la que somos grandes fans por su sencillez a la hora de instalar) y una versión de GRASS ya preparada, ahorrando al usuario la necesidad de instalar todo por separado. Esta opción última podría convivir con las interiores y estamos pensando mucho la forma de llevar esto a cabo. Mas información en breve...

Ah, y feliz año a todos.

Sesiones de Trabajo SEXTANTE

2009-12-16T13:20:00.002+01:00

Era una idea que teníamos en mente desde hace tiempo, y que al final nos hemos decidido a materializar. Si tienes un par de días en mayo y te interesa interactuar con otros usuarios y desarrolladores de SEXTANTE, estás de suerte. Vamos a montar unas jornadas similares a aquel gran code sprint de Bolsena, pero solo dedicadas a SEXTANTE. Será informal y lo haremos en la residencia de la universidad, con muchas facilidades y precios económicos (alojamiento y pensión completa sobre los 35 euros)

Hemos abierto un wiki con más información, donde puedes apuntarte y añadir cuanto desees. Iremos añadiendole cosas poco a poco. Esperamos verte por aquí en mayo ;-)

Colaboraciones externas (II)

2009-12-16T11:34:00.002+01:00

Algunas de las colaboraciones que estamos recibiendo en SEXTANTE últimamente no son relativas a nuevos algoritmos, sino centradas en enlazar SEXTANTE con otras librerías de datos o programas (crear nuevos bindings), o bien corregir y modificar parte del nucleo de SEXTANTE o de bindings ya existentes.

De entre ellas, cabe destacar la integración con Gearscape (una plataforma muuuy prometedora que por aquí nos gusta mucho), llevada a cabo por Fernando Gonzalez, y el trabajo de César Martínez (un ex de gvSIG ahora metido en otras labores) para incorporar SEXTANTE a GeoKettle. Ambas comunicaciones se presentarán en Girona, como puse en otra entrada anterior, pero su estado de desarrollo es ya muy avanzado.

Por si no fuera poco, tanto Fernando como César están aportando nuevas ideas a SEXTANTE y descubriendo algunos bugs notables (creo que son los primeros aparte de mí que se meten a bucear en el código del núcleo de SEXTANTE...), y de formas distintas han logrado que SEXTANTE ya no tenga limitaciones a la hora de procesar grandes capas raster. Hasta el momento, las plataformas sobre las que corría SEXTANTE no lo permitían, pero Cesar ha modificado el binding con Geotools para añadir algunas funciones de tileado avanzadas, y Fernando ha hecho algo similar con el portente motor de Gearscape (GDMS), abriendo la puerta al procesado de imágenes verdaderamente grantes. César ha contribuido además un algoritmo al grupo de análisis de capas ráster categóricas, con lo que está tocando todos los palos y ayudándonos mucho a mejorar el programa.

Buenas noticias para el futuro del programa, que va ampliando su estabilidad, sus capacidades y su ámbito de aplicación.

Jornadas Girona

2009-12-01T12:41:00.003+01:00

Ya sé que las jornadas de Girona son dentro de unos meses y que ahora debería centrarme más en las de gvSIG (de hecho, estoy en Valencia ya a pesar de que empiezan mañana), pero acaba de llegarme una fantástica noticia que no puedo dejar pasar sin anunciarla en este blog: ¡Tenemos nuestra propia sección dedicada en las jornadas! 3 charlas sobre SEXTANTE que se agrupan en una franja horaria dentro de una denominada "Sección SEXTANTE". Algo fantástico, sobre todo porque además es el único software que reune las suficientes comunicaciones como para tener su propio bloque de presentaciones. Una noticia enorme, sin duda.

Las comunicaciones en cuestión son:

Integración de SEXTANTE en Gearscape.
Proyecto BeETLe: acercando SEXTANTE al mundo ETL.
Modelo anisotrópico de cálculo de rutas de coste mínimo con gvSIG y SEXTANTE.

Fuera de la sesión, tenemos otra que incluye SEXTANTE:

Viejos paisajes y nuevas tecnologías: Una reconstrucción del paisaje Holoceno con gvSIG y SEXTANTE.

En breve, más noticias desde Valencia ;-)

Colaboraciones externas (i)

2009-11-27T11:50:00.003+01:00

La comunidad de desarrolladores de SEXTANTE crece ultimamente bastante, y una buena parte de ellos están aportando parte de su trabajo para hacer crecer el número de funcionalidades de que disponemos o las plataformas en las que el programa puede correr. Una gran ventaja de la propia estructura de SEXTANTE es que el desarrollo más habitual es crear algoritmos nuevos para implementar algún proceso particular. Si este proceso es de interés para la comunidad, incorporarlo al conjunto de algoritmos de la distribución oficial de SEXTANTE es inmediato, con lo que colaborar con el proyecto requiere sencillamente ceder el código.

Una de las contribuciones más recientes nos llega de la Universidad de Muenster, donde se han desarrollado dos trabajos, a cual más interesante.

El primero de ellos es una implementación de algoritmos de simulacion geoestadistica, que forman una base para el cálculo de parámetros geomorfométricos no a partir de un solo MDT, sino de un conjunto de MDT simulados mediante técnicas geoestadísticas, modelizando la incertidumbre y permitiendo obtener resultados más realistas.

La otra contribución es bien distinta, e implementa los denominados "mapas de flujo". El algoritmo permite crear capas vectoriales con este tipo de contenido, ideal para representar movimientos o flujos. Más información en esta página web [pdf] o en la documentación de los algoritmos.

Ambas contribuciones están ya en el svn en sendos paquetes, y pasarán a formar parte de la próxima versión de SEXTANTE (0.5)

II SASIG. Evora

2009-11-16T10:45:00.003+01:00

Tengo el blog algo olvidado ultimamente, aunque no porque el proyecto esté parado como algunos pueden creer, sino más bien todo lo contrario. Hay mucha actividad relacionada con SEXTANTE y uno no tiene tiempo para todo. Y programar es más divertido que escribir en un blog, así que esta aparente inactividad es facilmente explicable :-) Por si fuera poco, también hay que seguir asistiendo a geo-saraos, con lo que el tiempo que queda es aún menor.

Uno de los últimos eventos al que he acudido fue el organizado en Évora por la gente de OSGeo Portugal, que me invitaron a realizar un taller de SEXTANTE y a pasar 3 dias relajados enterándome de cómo anda el panorama del SIG libre por esos lares. Los puntos más destacables del evento los resumo a continuación:

Buena organización y buenos medios. La bolsa de cortesía traía algunos panfletos y libros más de los recomendables, pero afortunadamente fui en coche (por primera vez en mi historia como conferenciante/charlatán) y no tuve que cargar con el peso de vuelta a casa.
Hice buenas migas con Patrick Hogan (el que manda en NASA WorldWind) y creo que esto va a suponer un importante paso en el avance del binomio SEXTANTE-WordWind. El globo 3D con capacidades de análisis que tengo preparado ya y que presentaré en Girona en Marzo puede aún crecer mucho, y con el apoyo que la gente de NASA parece dispuesto a brindarnos creo que podemos tener en no mucho tiempo una herramienta seria y novedosa, además de muy usable.
La cena de gala sin excesos pero de las mejores y más apañadas que he visto en este tipo de eventos. Un acierto. Además, compartí mesa con los chicos del Cartolab de Coruña, el inimitable Lorenzo Becchi y Jorge Sanz (Prodevelop), que fueron mi compañía durante los tres días, con lo que hubo charlas interesantes. Las pausas de cafe no eran tan deliciosas, pero tenían unas piramides de chocolate extremadamente adictivas (y si no, que se lo pregunten a Lalo...)
Poca presencia de gvSIG en comparación con lo que es habitual en similares conferencias en España. Quantum GIS parece estar a la par en cuanto a popularidad, o incluso ganarle la batalla. Algún que otro conferenciante mencionó a SEXTANTE en su charla, lo cual me sorprendió gratamente, a pesar de que no se mostraron desarrollos o usos muy novedosos.
La organización me alojó en un precioso hotel que, sin embargo, y haciendo buena esa incomprensible norma no escrita que dicta que cuanto más caro y lujoso es el hotel, menos posibilidades hay de que den wifi gratis, pedia 21 dolorosos euretes por un dia de conexión. Por suerte, la organización del congreso daba acceso wifi libre en el salón de actos, y pude trabajar algo, aunque el acceso al SVN no funcionaba y no pude subir lo que iba haciendo (no se puede pedir todo...)

En resumen, un congreso más por unas tierras que aún no había visitado como participante en un evento así, y que creo que además tiene mucho potencial para seguir creciendo en sucesivas ediciones.

Proceso por lotes ampliado

2009-10-02T18:26:00.002+02:00

La herramienta de proceso por lotes funciona actualmente en base a ficheros. Es decir, las capas o tablas de entrada no han de estar cargadas en el SIG sobre el que corre SEXTANTE, sino que se abren para realizar la operación que corresponda, y después se cierran, y nunca pasan por la interfaz del SIG como tal (por ejemplo, no se abren en una vista). A petición de algunos usuarios, he creado una nueva interfaz de procesos por lotes en la cual las capas de entrada no se toman directamente desde ficheros, sino que se emplean capas que ya estén abiertas. Esto puede permitir, por ejemplo, procesar en un lote varias capas que han sido generadas de alguna forma en el SIG (por ejemplo, con otros algoritmos de SEXTANTE), hacerlo sobre servicios remotos, siempre que el SIG en cuestion soporte la conexión a estos.

A este nuevo componente de SEXTANTE se accede de igual modo que a la interfaz clásica del proceso por lotes, haciendo clic con el botón derecho sobre un algoritmo y seleccionando "ejecutar proceso por lotes (sobre capas cargadas)". en este caso, el menú no está siempre disponible, ya que, al igual que al ejecutar un algoritmo aisladamente, dependerá de las capas que haya cargadas en ese momento en el SIG.

Y ahora en World Wind

2009-08-21T08:55:00.002+02:00

He estado jugueteando con World Wind y estoy encantado. Está bien programado y la API es facil de usar, con lo que da mucho juego y sin demasiado esfuerzo. Un gusto usarlo, vaya. Así que, probando y jugueteando, tengo ya un pequeño prototipo de SEXTANTE funcionando sobre él. Utilizando cosas de otra aplicación llamado GeoWind (que permite, usando Geotools, abrir capas como shapefiles y tif), he creado un pequeño globo 3D con SEXTANTE incorporado, de forma que puedes cargar tus capas, verlas en el globo, analizarlas con SEXTANTE y ver tambien los resultados.

Por ahora no es mucho, pero el tema de los globos 3D esta ahí y pegará con fuerza en el futuro como plataforma de trabajo GIS seria, no sólo para "mirar" imágenes de satelite (sin ir más lejos, la semana que viene estoy en Alemania participando en un curso de geoestadística con R y Google Earth...), así que es interesante ir abriendo estas vías. Por ahora no he subido nada a ningún lado (la licencia de World Wind no es compatible con la GPL, así que hay que verlo con detalle antes de distribuir nada), pero os dejo una imagen para ir abriendo boca (haz clic para verla más grande). Se ha usado Substance para la apariencia de las ventanas, para que quede algo más "resultón".

TIN

2009-08-21T08:49:00.002+02:00

Josef Bezdek, un estudiante de la universidad de West Bohemia en Pilsen (República Checa), ha escrito su Diploma Thesis sobre algoritmos para creación de isolíneas a partir de puntos. Lo interesante del tema es que ha implementado los algoritmos usando SEXTANTE, así que vamos a poder contar con ellos para añadir capacidades de generación y uso de TIN (porque se usan TIN para representar superficies) a SEXTANTE.

En particular, tenemos los siguientes algoritmos:

Generación de TIN
Generación de TIN con líneas de ruptura
Suavizado mediante interpolación BEZIER
Extracción de curvas de nivel a partir de TIN

Hay más información en http://git.zcu.cz/index.php/Sextante_algorithms, de donde se puede descargar incluso la tesis completa (en checo).

En resumen, una colaboración de gran nivel para SEXTANTE que nos hace crecer un poquito más.

Proyectando...

2009-07-22T12:58:00.002+02:00

Hoy he resuelto un bug curioso en los bindings de SEXTANTE con gvSIG. Resulta que he sacado una ruta del GPS y la he metido en gvSIG, y después me apetecía analizarla con las herramientas de SEXTANTE. Al hacer algo que generara otra capa, esta capa resultante no salia donde debía, y gvSIG parecía olvidarse de reproyectarla (la vista estaba en EPSG23030 y tanto la ruta original como los resultados estaban en EPSG 4326). En principio que todo lo que se hace con la capa parecía estar bien, y mantenía su CRS distinto al de la vista, pero aún así no acababa de pintarse bien. He buceado un poco en el gargantuesco código de gvSIG (hacía mucho tiempo que no lo hacía, y me ha costado situarme, la verdad) y al final he dado con la siguiente solucion: al añadir la capa a la vista, hacer esto:

layer.setProjection(layer.getProjection());

No es nada lógico, pero eso dispara el mecanismo de la reproyección a la hora de pintar. Seguro que hay una forma más limpia de hacerlo. A ver si algún gurú de gvSIG nos saca de dudas ;-)

Ya que estaba con el tema de las proyecciones y similares, he añadido un aviso en la consola de SEXTANTE cuando las entradas de un algoritmo con varias entradas no coinciden en su CRS, ya que SEXTANTE no gestiona tema de cambios de sistemas de coordenadas y asume que ya deben estar todas las capas de entrada en uno único que permita operar de forma coherente.

Nottingham (2)

2009-07-21T21:54:00.002+02:00

Un apunte breve a añadir a la entrada anterior sobre el congreso de Nottingham:

Tyler Mitchell ha añadido una entrada al respecto en su blog, adornada con un par de fotografías, una de ellas correspondiente a mi charla :-) Hay además un enlace al album de Mateus Loskot, con una cuantas más, para el que tenga curiosidad. Un poco de publicidad nunca viene mal ;-)

Nantes OGRS 2009

2009-07-21T12:42:00.003+02:00

Despues del congreso de Nottingham, me fui a Nantes a otro interesante evento geo. Como es habitual, aquí van algunas reflexiones al respecto:

Uno de los mejores congresos en los que he estado, si no el mejor. Muy buena distribucion del tiempo, buenas charlas, organización sin apenas fallos y, sobre todo, mucho lugar y medios para hacer contactos y trabajar con otros asistentes al congreso. Como experiencia global, ha sido muy satisfactoria.
Los enchufes siguen siendo el principal problema, sobre todo si te gusta trabajar en lugar de ir a las charlas como es mi caso. Afortunadamente, había uno al lado de la escalera, con lo que podías medio sentarte y echar unas horitas alli, eso sí, a la vista de los demas. En este lugar hice la mayor parte de mi actividad en el congreso, junto a Markus Neteler. ¿Que qué es lo que hicimos? Pues se nos ocurrio intentar enlazar GRASS con SEXTANTE...y ya está la cosa medio terminada. El rendimiento no pudo ser mejor. Yo aprendí mucho de GRASS y a él la idea le pareció suficientemente interesante como para trabajar conmigo, así que me volví con un código pulido y casi completamente funcional. Ahora falta acabarlo y testearlo, por supuesto. Sin duda, esto va a suponer un gran avance. Más detalles en una proxima entrada.
OpenJUMP siempre ha sido una plataforma que me ha gustado mucho, y de la que Nacho es gran fan. Despues de conocer a Stefan Steiniger, me gusta más aún, y creo que además hay algunas ideas de procesos y extensiones que pueden migrarse a SEXTANTE. La comunidad OpenJUMP parece bastante dispuesta a echar un cable, lo cual siempre ayuda y es de agradecer. Estuvimos hablando bastante de este tema, y espero que concretemos cosas en breve.
La barra libre de cruasanes es peligrosa...sobre todo si te quedas cerca de ellos. Me comí alguna nectarina (tambien dispuestas a mogollón para coger libremente) de vez en cuando, pero el número de cruasanes en tres dias debió superar la centena facilmente... Otro acierto de la organización, aunque no sea demasiado bueno para el colesterol.
El taller gustó mucho y creo que convenció a casi todos los asistentes, aunque es cierto que una buena parte ya conocía SEXTANTE. Lo unico malo es que me dieron un ordenador frances (es decir, con distribucion de teclas distinta, y que hay que pulsar mayúsculas para sacar los números, entre otras cosas), y lo pasé un poco mal cuando trabajamos en línea de comandos. Al menos, la gente se lo pasó bien viéndome sufrir al teclear.

UK OS GIS 2009

2009-06-26T10:09:00.003+02:00

Unas rápidas frases ahora que he vuelto de Nottingham:

El congreso estaba bien organizado...pero ha sido una paliza. Charlas cortas a un ritmo infernal y en dos sesiones paralelas, todo para poder meterlas en un único día. Demasiado. Dos días dan para más, se hace todo más relajado, y además favorecen que haya más componente social en el evento.
Buena acogida de SEXTANTE por parte de la gente que no lo conocía. Había también quien lo conocía y estaba algo descolgado de las últimas novedades y se ha puesto al día, y quien lleva trabajando con él un tiempo y haciendo cosas bastante chulas. La propuesta más interesante que vi fue la de Daniel Ames, de la Universidad de Idaho, que tiene a un estudiante de doctorado haciendo una tesis que consiste en crear un recubrimiento para SEXTANTE, de forma que pueda utilizarse desde .Net, para así integrarlo en su componente MapWindow. Suena prometedor.
Me dieron un premio de mejor ponencia...que casi me quedo sin recoger, porque justo estaba a punto de irme de la sala (a esas horas del final de la tarde, ya uno no puede más...). Totalmente inesperado, pero hace ilusión :-)
Tengo que comprarme un adaptador multiple para viajar a cualquier sitio sin tener problemas con el enchufe del portatil. Pasar un día en un congreso sin poder usar el portatil es bastante duro...¡tienes que ir a las charlas! :-P

Cursos, congresos, menciones y otras cosas

2009-06-10T11:17:00.002+02:00

Ahí va un rápido conjunto de cosas y actividades relacionadas con SEXTANTE, más o menos confirmadas para los próximos meses, para que veáis que no todo el trabajo es sentarse y pegarle a las teclas.

El 22 de junio estaré en Nottingham presentando SEXTANTE en la First Open Source GIS UK Conference. Después aprovecharé para pasar un día en Oxford con la gente de Oxford Archaeology, que hacen cosas muy interesantes con SEXTANTE, para ver si juntos somos capaces de sacar alguna nueva idea.
Del 8 al 10 de julio estaré en Nantes haciendo un taller sobre SEXTANTE en OGRS 2009: International Opensource Geospatial Research Symposium
Del 24 al 28 de agosto participaré en Muenster (Alemania) en el curso Spatio-temporal data analysis with open source GIS, en el que se trabajará con software de análisis geoespacial, entre ellos SEXTANTE. Aprovecharé la visita para trabajar también con la gente de 52N, que andan por allí cerca.
A principios de octubre volveré a Alemania, esta vez a Munich, para dar dos cursos sobre SEXTANTE: Programmierung in SEXTANTE y Einführung in SEXTANTE

El evento que me saltaré sera el FOSS4G de Australia, porque creo que no merece la pena. Demasiado lejos, y además el año que viene será en Barcelona, así que mejor guardo energías. Probablemente para finales de año intente hacer algo de trabajo conjunto con la gente de OpenGeo, con quien ya he hablado para hacerles una visita a su sede en Nueva York, y con un poco de suerte podremos poner medio en marcha SEXTANTE en GeoServer. Por el momento, ellos ya han puesto esto en su roadmap, con una mención más que interesante a SEXTANTE, como puede verse aquí.

Herramientas para usuarios gvSIG: Capturador de puntos

2009-05-28T10:18:00.003+02:00

Una de las cosas que más se echan de menos respecto al antiguo SEXTANTE (el que funcionaba solo sobre gvSIG) es la posibilidad de capturar los puntos interactivamente desde la propia ventana de ejecución de un algoritmo. Para solucionar esto, y aunque no es exactamente lo mismo, he creado una herramienta adicional que permite recoger las coordenadas de tantos puntos como se desee, y después seleccionarlas a la hora de introducir un punto como entrada para un algoritmo, evitándose así el tener que teclearlas.

La herramienta la encontraréis junto a los otros botones de SEXTANTE, con un icono en forma de diana. Seleccionando la herramienta y pinchando sobre la vista, se capturan las coordenadas del punto. SEXTANTE os informará con un simple mensaje como el siguiente.

Después, una vez en el dialogo de ejecución del algoritmo, no tenéis más que hacer clic en el botón que ahora aparece en el campo en cuestión y seleccionar la coordenada que habéis capturado.

Espero que en breve esta herramienta esté también en OpenJUMP.

Pequeños (grandes) cambios en la interfaz

2009-05-18T17:38:00.006+02:00

Nacho y yo hemos estado trabajando estos últimos días mano a mano para añadir algunas pequeñas ideas que creemos que mejorarán la experiencia del usuario al trabajar con la caja de herramientas, el elemento principal de la parte gráfica de SEXTANTE.

Ahí van algunas de esas novedades:

1) Tooltips en los parámetros. Al dejar el ratón sobre algún parámetro, muestra una descripción de éste extraída de la ayuda.

2) Manejo con teclas. El árbol de extensiones se puede recorrer sin ayuda del ratón, y también llamar a los algoritmos o a los procesos por lotes usando sólo teclas.

3) Los modelos se pueden localizar en cualquier rama del árbol de algoritmos. En lugar de tener una rama particular para ellos, tienen un icono distinto que permite identificarlos.

Para elegir en qué grupo va un modelo, la interfaz del modelizador ahora permite seleccionar un grupo, pudiendo elegir entre los ya existentes o teclear uno nuevo.

4) Posibilidad de mostrar sólo algoritmos activos. En lugar de ponerlos en gris, pueden ocultarse aquellos algoritmos que no pueden ser ejecutados por no haber suficientes datos. Asimismo, si se muestran todos, las ramas que contienen solo algoritmos inactivos aparecen con color en gris (antes los nombres de los grupos siempre salían en negro) para que sea mas intuitivo y rápido localizar lo que se busca.

5) Como ya habréis notado, la cigüeña ha volado, llevándose consigo la navaja suiza. :-P

Explorador de datos

2009-05-13T12:14:00.002+02:00

Una de las carencias mas notables tanto en gvSIG como OpenJUMP, así como otros SIG libres, es la falta de soporte para valores de celdas sin datos. Gestionar correctamente estos valores y permitir que el usuario pueda configurarlos según sus necesidades aporta una potencialidad muy importante para el uso de muchos algoritmos de SEXTANTE, y sin ella se pierde una gran parte de posibilidades.

Empecé hace tiempo a pensar en la manera de ofrecer al usuario mayor control sobre los valores sin datos, y he acabado creando una pequeña herramienta para explorar las capas (tanto raster como vectoriales) disponibles para su uso con SEXTANTE. Para cada capa se muestran algunos valores relevantes, entre ellos el valor para representar celdas sin datos, que además puede editarse sin más que hacer clic sobre él con el boton derecho y seleccionar "Modificar".

Quiero enriquecer la herramienta para que permita hacer mas cosas y muestre más información, pero por el momento ya cumple su objetivo inicial.

Dejo una captura para que os hagais una idea del aspecto que tiene.

Algo más de ayuda

2009-05-03T11:51:00.002+02:00

Aunque ultimamente compruebo que la gente usa el modelizador y la línea de comandos, sigo pensando que son elementos de SEXTANTE desaprovechados por la mayoría. Es cierto que pueden ser algo difíciles de utilizar (en especial la línea de comandos), ahorrarían mucho trabajo a mucha gente si se les sacara todo el partido posible, o al menos algo más que el actual. Por ello, he preparado algunos modelos de ejemplo, con varios grados de complejidad, que se incluirán en la próxima versión de SEXTANTE, para que los usuarios puedan estudiarlos y ver cómo estan diseñados. Además, la ayuda asociada a estos modelos no sólo describe lo que hace, sino que he adjuntado fragmentos de código que, utilizados en la línea de comandos, harían algo similar, para que aquellos que estén interesados puedan aprender un poco más sobre su funcionamiento viendo un caso real.

Todos los que hayais utilizado tanto el modelizador como la línea de comandos, podeis sugerir ideas o mandarme vuestros modelos y scripts, para poder ampliar esta pequeña colección y así dar a futuros usuarios más información sobre el uso de SEXTANTE. Gracias de antemano.

Avances en el cliente WPS

2009-04-13T09:24:00.002+02:00

Sigo avanzando en el cliente WPS, que ya va bastante fino, al menos en lo que a geoprocesos vectoriales respecta (los raster dan algo más de guerra). Además de poder meter procesos WPS como algoritmos SEXTANTE dentro de la caja de herramientas, ya se pueden meter dentro de modelos, (y almacenar modelos que contengan WPS), ejecutar desde la línea de comandos, y acumular en el historial. Es decir, básicamente todo lo que se puede hacer con un algoritmo normal que no sea remoto. Un poco más de testeo, pulir la parte raster, otro poco más de testeo...y listo para usarse. Como bien ha comentado mucha gente, otra cosa es encontrarle una utilidad práctica a esto, pero sin duda es un trabajo muy interesante, porque WPS está ahí y se está haciendo poco desarrollo "real" sobre su base, con lo que esto es un gran paso adelante para SEXTANTE, especialmente si además tenemos en cuenta que en el lado del servidor también estamos jugando un papel importante junto a la gente de 52N.

spsextante

2009-04-07T17:06:00.003+02:00

Se ha registrado en la forja de R (ese programa que seguro que os suena para hacer mil millones de tipos de estadísticas...) un nuevo proyecto llamado spsextante, que pretende crear una libreria que permita llamar a SEXTANTE desde R. Es similar a RSAGA, y si se queda en eso probablemente no aporte más diferencia que permitir el acceso a aquellos algoritmos que están implementados en SEXTANTE pero no en SAGA. No obstante, creo que se le puede sacar más partido si en lugar de llamar a SEXTANTE se hace un verdadero conector que permita a SEXTANTE acceder a los datos de R directamente, sin necesidad de tener que exportar éstos a un fichero (en el caso de RSAGA, en uno de los pocos formatos que la versión en linea de comandos de SAGA soporta, básicamente .dgm y .shp) y luego leerlos. Veremos que es lo que sale, y hacia donde se orienta el desarrollo.

El proyecto no tiene nada que ver directamente conmigo, pero creo que es una muy buena noticia, así que intentaré aportar todo lo que me sea posible. Si hay por ahí alguien que use R y SEXTANTE y quiera contribuir, se le invita a que se una ;-)

Seleccionando...

2009-04-01T12:59:00.002+02:00

Hace poco le añadí a SEXTANTE una arquitectura de filtros, de tal forma que para una capa de entrada vectorial, sólo parte de sus entidades se procesan. De este modo, se podrá trabajar con capas con múltiples tipos de entidades (lineas y puntos juntos, por ejemplo), o analizar sólo dentro de una región dada. Esto último en algunos casos dará más rendimiento a los algoritmos, ya que, por ejemplo si está Geotools por debajo, se podrá convertir ese filtro en uno propio de Geotools, y la iteración se hará eficazmente, devolviendo sólo las entidades correspondientes, y siendo Geotools mismo el que haga ese filtrado con sus mecanismos bien elaborados y optimizados.

Otro de los usos de los filtros es el de emplear sólo las entidades seleccionadas, aunque esto sólo tiene aplicación en el caso de que SEXTANTE esté en un SIG que permita dicha selección. Con este objetivo (y aunque al final he decidido usar una mecánica algo diferente), he implementado un filtrado por selección, de tal modo que a partir de ahora (y por el momento sólo en la versión para gvSIG), los algoritmos trabajarán sólo sobre las entidades seleccionadas. Si no hay selección, se usarán todas, que es el mismo comportamiento que había antes.

Desde mi punto de vista, esto resulta útil y permitirá ganar tiempo en ciertas tareas. Espero vuestras opiniones. Los interesados en probarlo, lo encontraran como siempre en la versión diaria.

Una de artículos

2009-03-31T09:39:00.002+02:00

Ahí van dos pequeñas noticias sobre artículos relacionados con SEXTANTE:

A través de la lista de OSGeo se ha coordinado el trabajo de traducir el texto que la Comisión Europea publicó en inglés acerca del proyecto SEXTANTE. Ahora puede encontrarse también en español en esta dirección. Huelga decir que desde SEXTANTE agradecemos enormemente este trabajo a todos los que han aportado su granito de arena a la traducción.
La gente de Ingeniería sin Fronteras ha publicado uno más de sus cuadernos, en este caso dedicado a las tecnologías de la información geográfica. Un servidor colabora con un artículo sobre GIS libre y geodatos libres en países desarrollos. El artículo puede leerse en un pdf en la web de ISF

Dándole uso al historial

2009-03-25T11:09:00.003+01:00

Todo lo que uno hace con SEXTANTE se va almacenando en el historial, y luego puede utilizarse para repetir procesos de forma más sencilla. Aunque es una herramienta útil, se le puede sacar más partido, y con este objetivo he añadido una nueva funcionalidad a la interfaz básica para ejecutar algoritmos, que permite recuperar los parámetros de ejecuciones anteriores y rellenar automáticamente los valores de la ventana de parámetros.

Ahora, por defecto, cuando uno llama a un algoritmo la ventana se llena con los valores de la última ejecución de ese algoritmo en caso de que se encuentre alguna en el historial. Si hay varias, se muestra además una fila en la parte inferior con botones de avance y retroceso, que permiten recuperar otras ejecuciones del historial. Esto es además util porque "traduce" las expresiones en lineas de comandos, poco legibles si uno no está acostumbrado a esta forma de llamar a los algoritmos, a ventanas de parámetros más fáciles de entender para el usuario medio.

Dejo una captura de pantalla para que os hagáis una mejor idea.

Se admiten más ideas para seguir mejorando la interfaz del programa.

SEXTANTE - 52N

2009-03-24T14:37:00.002+01:00

Parece ser que mientras he estado fuera los chicos de 52N no han perdido el tiempo, y publicaron hace ya algún tiempo una nueva versión de sus servidor WPS, que esta vez ya incluye SEXTANTE y es capaz de servir procesos basados en él. No me había enterado de la noticia hasta hace algunos días, pero la verdad es que me llena de felicidad ver cómo otros sacan partido a la librería de muy diversas formas.

Bastian, el capitán del equipo de 52N dedicado al tema de WPS, estuvo dando una charla sobre la integración SEXTANTE - 52N en el FOSS4GIS de Hannover de la semana pasada, y al parecer la aceptación ha sido muy buena y ha despertado gran interés. Alemania ya es una zona donde hay usuarios de SEXTANTE, pero toda ocasión es buena para darse a conocer algo más...especialmente si no tienes que hacer nada más que irte de vacaciones y que otros lo hagan todo por ti :-) Si es que estos alemanes son muy profesionales...

Ahora queda probar seriamente ese servidor, y la mejor forma sin duda es con el cliente WPS de SEXTANTE, que esperemos dentro de poco pueda tener todos los algoritmos de siempre...pero en remoto. Veremos a ver qué se puede hacer.

Versión diaria

2009-03-05T20:03:00.002+01:00

Vuelve a haber versión diaria de SEXTANTE. No es un instalador, sino simplemente un zip con los ficheros de la librería y las dependencias(y no contiene bindings ni nada extra). Se accede a él desde la sección de descargas, y está pensado para usuarios avanzados, ya que con esos ficheros habrá que sustituir los viejos en donde corresponda (según el tipo la instalación que se tenga). No es muy difícil, pero tampoco tan obvio.

El fichero que hay ahora notareis que es mucho más grande que el instalador. Esto es porque ya contiene las dependencias necesarias para el cliente WPS (vease entrada anterior), pese a que éste aún no funciona.

Cliente WPS

2009-03-05T11:03:00.003+01:00

He comentado ya algunas veces que una buena parte del futuro de SEXTANTE pasa por dar el salto a la web. Poner SEXTANTE en el lado del servidor es la opción más interesante y donde tenemos más que decir, aunque el lado del cliente tampoco hay que olvidarlo. Con el apoyo económico de la gente de gvSIG, estoy trabajando en un un cliente WPS integrado con SEXTANTE, que permita llamar a procesos remotos desde las interfaces habituales de SEXTANTE.

El funcionamiento es conceptualmente sencillo (aunque las tripas son algo más complejas...), y basicamente lo que hace es recubrir un proceso WPS de forma que se convierta en un geoalgoritmo de SEXTANTE, el cual ya puede emplearse de la forma habitual. La misma estrategia usada en los modelos del modelizador, pero con otro tipo de procesos.

Por el momento la cosa no está terminada, y es difícil hacer algo que funcione bien en un contexto tan genérico (WPS en muy laxo en muchas cosas, y buena parte de los de los pocos procesos disponibles por ahí para probar están pobremente definidos, con mala semántica y sin sacarle todo el provecho a las posibilidades de WPS), pero al menos ya conecta a servicios y es capaz de convertir sus requerimientos en las clásicas y familiares interfaces de SEXTANTE.

Dejo una captura para dar testimonio de ello :-)

Seguiré trabajando estos días hasta la semana que viene, para poder añadir esto a mi presentación en las jornadas de Girona, como una pequeña sorpresita ;-) Y probablemente, si todo sale bien, la próxima versión de SEXTANTE ya incluya este cliente WPS integrado.

Una baja en el equipo :-(

2009-03-02T07:39:00.004+01:00

Después de dos meses sin tocar una tecla, he vuelto con ganas al trabajo desde esta misma mañana, y aunque hay bastante que hacer (como siempre...), no parece que haya demasiados cambios en lo que a SEXTANTE respecta. Hay, sin embargo, un detalle que cambia bastante el trabajo, y es que a partir de ahora ya no tendremos en SEXTANTE a Antonio, nuestro compañero de los últimos meses en el despacho. A partir de ahora estará trabajando por Valencia (no es mal sitio, ya que por allí pasamos a menudo y le haremos visitas) y esperemos que intentando convencer a las gentes de allí de que deben usar el programa :-)

Durante el tiempo que ha estado en SEXTANTE, algo más de un año, Antonio se ha encargado de testear el programa y escribir una gran parte de la ayuda, ademas de preparar algunos documentos y cursos. Y sobre todo, de ser un buen colega de trabajo. Así que ahora que vuelvo a la rutina y me toca trabajar de nuevo quiero dedicarle esta entrada en el blog para desearle buena suerte y para remarcar su importante papel en SEXTANTE. Si algo de lo que usáis en SEXTANTE funciona bien, es muy probable que al principio no fuera así, y que haya sido gracias a su paciencia y a su concienzudo testeo como hayamos encontrado esos fallos que luego hemos corregido hasta llegar a lo que hoy es SEXTANTE.

Un abrazo desde el SEXTANTE para el primer "ex" del equipo, aunque sin duda seguiremos manteniendo su foto en la web como parte del grupo, que se lo merece.

Estudio de OSOR sobre SEXTANTE

2009-03-02T07:20:00.002+01:00

Como ya sabéis, el proyecto OSOR de la UE nos facilita alojamiento y los medios necesarios para gestionar el proyecto y su presencia en la web, tales como el wiki o el SVN. OSOR publica además informes periódicos sobre algunos proyectos destacados de SL, con el objeto de difundir el software libre y tener una base de documentos a los que acudir para consultar casos de éxito o estrategias particulares, entre otras cosas.

Ahora le ha tocado el turno a SEXTANTE y nos han hecho un estudio breve pero muy interesante, que recomiendo a todo aquel que quiera saber un poquito más sobre nosotros y la manera en que funcionamos. Se puede consultar en este enlace.

SEXTANTE en la Web

2008-12-31T11:36:00.002+01:00

El futuro, sin duda, está en la Web, y los clientes ligeros SIG están dejando de ser tan ligeros. Una cosa que aún no tienen son capacidades "serias" de análisis, pero para eso está SEXTANTE, ¿no?. :-)

Para despedir el año (y ésta ya sí que va a ser la última entrada antes de irme de viaje...), os dejo un enlace para que podáis ver en qué línea estoy trabajando para que SEXTANTE dé el salto a la Web en el lado del cliente (en el del servidor, ya tenemos a la gente de GeoServer y 52N dándole a las teclas). No es nada oficial, y lo he estado haciendo en mis ratos libres, pero creo que ahí está el futuro de SEXTANTE. Y si no, tiempo al tiempo.

¡Feliz año!

Geomorphometry

2008-12-29T16:43:00.002+01:00

Después de miles de lios y problemas varios, por fin me ha llegado a casa el ejemplar de cortesía que la gente de Elsevier me ha enviado por participar en el libro Geomorphometry. Concepts, Software and Applications. Eso quiere decir, por supuesto, que el libro ya está a la venta, así que todo aquel que lo quiera puede comprarlo en esta pagina (altamente recomendable, ya que participan personajes de la talla de Ian Evans, y además sale por unos bastante asequibles 90 euros, bastante buen precio para el tipo de libro que es).

Yo en particular aporto los capítulos "Geomorphomery in SAGA" y "Basic morphometrical parameters", y los curiosos podrán encontrar además en el prologo un par de fotos mías, cortesía del editor que es un tipo cachondo y ha añadido algún que otro comentario divertido. Me gusta que los libros de ciencia seria no sean siempre tan serios :-)

No aparece SEXTANTE, pero si alguno quiere saber mas sobre lo que hay por detrás de los algoritmos de geomorfometría e hidrología de SEXTANTE, o bien mira el código fuente, o si no siempre puede comprar este libro...

SEXTANTE se va de vacaciones

2008-12-26T17:03:00.003+01:00

Para lo que seguís atentamente las novedades del programa, esta entrada es para avisaros de que no va a haber muchas en los proximos 2 meses (hasta el 28 de febrero, para ser más exactos). Como este es un geo-blog, en lugar de escribir la razón de este parón, os pongo un mapa que seguro que lo deja bastante claro. Es muy poco detallado y probablemente sea poco fiel a lo que realmente acabe haciendo, pero sirve como idea general ;-)

Aunque quien esto escribe se va a ausentar una buena temporada, no hay que olvidar que el equipo SEXTANTE va creciendo y otros ya colaboran con el proyecto, y es probable que sigan aportando su granito de arena. La integración GeoServer-SEXTANTE sigue en marcha por parte de la gente de OpenGeo (y espero poder escribir algo interesante sobre este tema cuando regrese), y Nacho seguirá trabajando en los bindings con Kosmo. Yo por mi parte me desconecto de listas de correo, blogs y similares...aunque prometo volver con energías renovadas con que poner en práctica las muchas ideas que tengo para seguir mejorando SEXTANTE.

Feliz navidad a todos, y nos vemos a la vuelta :-)

Bug tracking

2008-12-19T10:48:00.002+01:00

Para todos aquellos que utilizáis SEXTANTE y estáis deseosos de colaborar informando sobre todos esos bugs y errores que vais detectando, os informo que ya podéis hacerlo a través del sistema de bug tracking de OSOR, que ya se encuentra activo. Podéis acceder a él en este enlace, o desde la página principal del proyecto. Es decir, no más mails directos a mi correo (que por otra parte, agradezco a todos aquellos que os habéis tomado la molestia de mandarlos en alguna ocasión. Ya sabéis que vuestra colaboración es muy apreciada) . ¡Gracias por vuestra ayuda!

Coruña 2.0

2008-12-19T10:33:00.002+01:00

Para terminar este año lleno de charlas, viajes y eventos, estuve el martes en Coruña participando por segunda vez en el "Master en Enxeñaria del Auga", enseñando a los alumnos los elementos de SEXTANTE relacionados con la hidráulica y la hidrología.

Si SEXTANTE ha mejorado en este año (o eso espero...), parece que también la experiencia de asistir a cada evento va mejorando poco a poco, con lo que resulta más agradable repetir lugares. Si el año pasado fui y volví desde Plasencia en sendos autobuses nocturnos, este año también he tenido que hacer visita relámpago (el año que viene prometo quedarme más...éste la agenda estaba demasiado apretada), pero esta vez en cómodos trenes hotel desde/hasta Madrid. Y en lugar de volverme con las manos vacías, me han obsequiado con una chula camiseta de la universidad, que he de decir que me ha hecho mucha ilusión, entre otras cosas porque es de la pocas camisetas aptas para vestir que he recibido en los últimos cien congresos/charlas a los que he asistido.

En definitiva, una charla más a la que espero poder acudir el año que viene, ya que siempre es un placer disfrutar de la gente del CartoLab y el trato exquisito de sus miembros, con Alberto Varela a la cabeza. Y además, por si eso fuera poco, aprovechamos unas horas por la mañana para perfilar algunas ideas para colaborar en un proyecto relativamente grande que creemos que va a dar mucho que hablar. Aunque eso mejor lo cuento otro día... ;-)

Nueva versión

2008-12-10T12:57:00.003+01:00

Ya esta en la calle la nueva versión de SEXTANTE, apenas unos pocos días después de que hayan acabado las jornadas de gvSIG. La tenía ya más o menos lista antes de ir para Valencia, pero he preferido esperar, aunque después de haber visto en vivo y en directo que la comunidad de SEXTANTE no para de crecer no he podido aguantar mucho a publicar una nueva versión.

No hay ningún cambio muy notable, aunque se han arreglado muchos errores de la primera versión, principalmente cosas que aparecieron en el paso a la librería y que se han detectado con el paso del tiempo.

Ya tengo mi lista de ideas para la siguiente versión, aunque por el momento voy a conformarme con ver cómo funciona ésta e intentar estar atento a los comentarios de los usuarios y corregir bugs que vayan saliendo.

Desde aquí un gran agradecimiento a todos, especialmente a aquellos con los que tuve ocasión de charlar e intercambiar opiniones sobre SEXTANTE en Valencia, por demostrar vuestro interés, aprecio y apoyo al proyecto. Espero que esta nueva versión sea más útil que las anteriores y podáis tener en ella a una herramienta valiosa y fiable con la que llevar a cabo vuestros geoanálisis.

Jornadas gvSIG

2008-12-05T13:53:00.002+01:00

Aún en Valencia a falta de que terminen por completo las jornadas, aquí van algunas reflexiones (tengo muchas, así que probablemente esta entrada tenga pronto una secuela cuando saque algo mas de tiempo)

La presencia de SEXTANTE ha aumentado muy notablemente. De los posters presentados, aproximadamente la mitad incluyen el uso de SEXTANTE, y se ha mencionado el programa como herramienta fundamental en algunas de las ponencias. Incluso en los carteles publicitarios de las empresas empieza a aparecer escrito. Esto es sin duda un signo de que estamos alcanzando una gran madurez, de que se empieza a dar un uso real al programa, y, sobre todo, de que existe un mercado y un amplio abanico de posibilidades para hacer negocio sobre la base de SEXTANTE. Sin duda, esto va a requerir replantearse algunas cosas, pero por el momento es una señal excelente, sobre todo teniendo en cuenta que este es probablemente el año en que menos esfuerzo he hecho yo directamente por darle promoción al programa. Parece ser que ya hay otros que lo hacen, lo cual me llena de alegría.
Hay todavía mucho que avanzar en SEXTANTE y en la unión entre SEXTANTE y gvSIG. Estas jornadas han sido importantes para darme cuenta de cuáles son los pasos más urgentes, cuáles los más interesantes a medio y largo plazo, y cómo hacer trabajo conjunto con las partes interesadas. Algunas de las ideas que me he apuntado y en las que espero empezar a trabajar pronto son:

Migración de nuevos algoritmos vectoriales y de elementos de análisis topológico, que han sido añadidos en la nueva versión de gvSIG. Con la ayuda de su creador, Álvaro Zabala, intentaré que esas funcionalidades se implementen con base en SEXTANTE y así puedan aprovechar las capacidades de la plataforma y ser aprovechadas además por todos los usuarios de SEXTANTE, ya sean usuarios de gvSIG o de otra aplicación
Terminar los algoritmos de enlace entre SEXTANTE y HEC-RAS. Comencé a hacerlos hace tiempo y lo he dejado aparcado por algunos problemillas, pero ésta es una funcionalidad que me la piden continuamente (y a lo largo de esta semana en numerosas ocasiones), así que habrá que subirla en la lista de prioridades.

La integración de SEXTANTE y 52N es ya una realidad. Aunque Bastian Schaeffer (de 52N) estaba esta semana aquí para la reunión de OGC, no conseguimos sacar un rato para mirar los pequeños problemas que había. Aun así, esta mañana me he encontrado con Laura Díaz (la otra responsable de esto) y casi sin quererlo nos hemos puesto a trabajar un poco en medio de un charla...y hemos resuelto los problemas en diez minutos! Las pruebas que hemos hecho despues han funcionado sin problemas, y ya hemos obtenido resultados viniendo directamente de un SEXTANTE sobre 52N. Hay más cosas que hacer para aumentar las posibilidades y darle más estabilidad (falta sobre todo más testeo), pero al menos la cosa ya marcha, que no es poco. Esto tampoco tiene mucho que ver con gvSIG...pero me apetecía ponerlo :-P

Y estas son algunas ideas más o menos técnicas. Las ideas y pensamientos más filosóficos y de similar índole me las guardo para otra entrada.

SEXTANTE en Kosmo

2008-11-19T15:05:00.003+01:00

Kosmo es otra de las aplicaciones SIG de escritorio relativamente populares, basada en OpenJUMP aunque con bastantes modificaciones. La Junta de Extremadura utiliza indistintamente gvSIG y Kosmo, así que nos han encargado que implementemos también SEXTANTE en Kosmo, de forma que puedan disfrutar de las capacidades de análisis del programa en ambos SIG.

Por el momento, la parte vectorial está resuelta, ya que es muy similar a la de OpenJUMP y existían bindings que se han podido aprovechar bastante. Ahora falta la conexión con la parte raster y algunas piezas genéricas, y esto lo iremos haciendo poco a poco a lo largo de las próximas semanas.

El encargado de desarrollar este enlace entre Kosmo y SEXTANTE no soy yo, sino que por primera vez en la historia de SEXTANTE tenemos un programador más. El nuevo miembro del equipo SEXTANTE, que esperemos que pueda seguir trabajando con nosotros durante mucho tiempo (inicialmente van a ser 3 meses), es Nacho Varela, perteneciente al Cartolab de la Universidad de A Coruña. Nacho estuvo por aquí en aquel curso de programación de SEXTANTE que organizamos hace algún tiempo, así que esto de SEXTANTE no le resulta desconocido.

Ademas de esto, tiene también su propio blog sobre SIG, y seguro que irá comentando las novedades de su trabajo con SEXTANTE, así que no lo perdáis de vista porque la cosa promete ;-)

Si hay suerte y el trabajo se da bien, se publicará un paquete de instalación de SEXTANTE para Kosmo antes de fin de año, probablemente cuando lancemos la nueva versión (0.15). Ésta irá acompañada de novedades como la ayuda en inglés o algunos algoritmos nuevos, y corregirá todos los errores que se han detectado en la primera versión de la librería.

Más algoritmos

2008-11-13T19:48:00.002+01:00

Hacía tiempo que no escribía nuevos algoritmos y sólo trabajaba en el núcleo de SEXTANTE y en otras cosas para poder sacar una versión más estable para las jornadas de gvSIG, así que hoy me he relajado un poco y he añadido un par de ellos, para así romper la monotonía.

El primero es un algoritmo para pasar un test de normalidad a una variable de una capa vectorial, en particular el test de Shapiro-Wilk. Como suponía que ya alguien lo habría implementado antes que yo, y probablemente en Java existiera algo ya hecho, he buscado un poco y he reutilizado codigo...de LimeWire! Ventajas del software libre ;-)

El segundo es una ampliación del anteriormente denominado "sinuosidad", que ahora se llama "propiedades geométricas de lineas" y ademas de medir las variables que medía antes, hace también algunos análisis estadísticos de los ángulos entre segmentos de cada línea.

Nada demasiado importante, pero poco a poco la colección de algoritmos de SEXTANTE va creciendo y mejorando, que es lo que en el fondo importa

Algo de personalizacion

2008-11-10T08:43:00.003+01:00

Sigo dándole vueltas a la forma ideal de disponer los algoritmos disponibles para que al usuario le resulte lo mas sencillo posible acceder a ellos y encontrarlos, al mismo tiempo que permita a los desarrolladores darle algo de identidad propia a su trabajo de forma sencilla, teniendo más posibilidades que simplemente incorporarlos a la gran masas de otros algoritmos ya existentes.

Una idea que acabo de implementar es la posibilidad de incorporar filtros en el panel que presenta el árbol de extensiones. Se puede crear cualquier filtro sin mas que implementar la interfaz IGeoAlgorithmFilter, y después se le pasa al constructor del panel, que sólo añadirá aquellos algoritmos que pasen dicho filtro.

De esta forma, se puede crear una caja de herramientas más personalizada, que contenga sólo unos algoritmos dados, o replicar el comportamiento de la antigua caja de herramientas, con varias pestañas (utilizando sencillamente varios paneles, cada uno de ellos con un filtro distinto). Asimismo, pueden crearse varias cajas de herramientas, lo cual puede ayudar a localizar mejor las extensiones (cada caja podría accederse desde un botón), así como a dar identidad propia a un grupo de algoritmos desarrollados por una empresa o bien a un conjunto de ellos que tengan algún rasgo común.

De cualquier forma, no es la solución definitiva, y la interfaz puede aún mejorar bastante. Seguiré dándole vueltas a la idea. Cualquier sugerencia por parte de los usuarios es, por supuesto, bienvenida.

Más allá de los ficheros

2008-11-05T08:57:00.002+01:00

La concepción de SEXTANTE era hasta ahora muy fichero-céntrica. Esto se podía entender estando dentro del contexto de un SIG como gvSIG (a pesar de que gvSIG se conecta a bases de datos e incluso ya tiene capacidades para publicar cartografía), pero en la actual situación de librería es necesario que las salidas se puedan manejar de un modo más flexible, no necesariamente metiéndolas en un fichero.

Andrea Aime (GeoTools/GeoServer) está trabajando en integrar GeoServer y SEXTANTE, y apuntaba hace algunos días que él necesitaría poder hacer algún tipo de streaming con los resultados que va generando SEXTANTE, a medida que éstos se van calculando. Con todo esto, estaba claro que había llegado el momento de darle una nueva visión a SEXTANTE en lo que a gestión de salidas respecta.

He sustituido el nombre de fichero que iba asociado a cada salida (y que si era nulo implicaba que se guardaría en un archivo temporal) por un objecto que implementa la interfaz IOutputChannel. Básicamente se trata de un objecto que dice "dónde" hay que poner los datos. Hay un FileOutputChannel, que replica el comportamiento anterior, pero la arquitectura permite ya desarrollar muchos otros, según las necesidades.

En los bindings de GeoTools hay una clase de prueba que testea la clase StreamOutputChannel, la cual define la salida con un simple PrintStream. El ejecutar alguna operación que vaya generando entidades vectoriales, a medida que éstas se añaden a la capa correspondiente, en lugar de añadirlas a un archivo lo que hace es imprimirlas al PrintStream, imprimiendo la descripción WKT de la geometría y después los valores de los atributos.

Es un cambio pequeño que no ha de afectar nada a los antiguos usuarios, pero que abre muchas nuevas posibilidades para otros, que espero sepan aprovecharlas.

Málaga OSWC 08

2008-10-29T09:24:00.002+01:00

Estuve hace unos días en Málaga, participando en la Open Source World Conference 08. Aquí van algunas de mis impresiones al respecto.

-El evento de OSOR, donde participé con una presentación improvisada justo la media hora anterior(¡Gracias, Fernando, por dejarme el ordenador para hacerla, y Jose Antonio, por dejarme el pen-drive para copiarla!) me pareció muy interesante, y confirma que OSOR es un gran proyecto con el que puedo tener cierta tranquilidad en lo que al alojamiento de SEXTANTE respecta.
-La asistencia es masiva (hablaban de 9000 personas), pero el ambiente es totalmente distinto a otros congresos. Mucha cantidad, pero poca calidad. Acostumbrado a participar en eventos con un público mucho mas especialista, esta conferencia es demasiado general y además está abierta a todo tipo de personas con independencia de su interés, lo que hace que el 80% de los participantes sean adolescentes en busca de CDs, bolis, etc.; gente que va a ver de que va aquello del SL, o quien quiere pasar un rato y llevarse una camiseta de regalo, entre otros. Afortunadamente, la sesión de OSOR fue de las más enfocadas, en mi opinión.
-Aunque hay de todo en todos lados, en conferencias o eventos sobre SIG Libre siempre he tenido la sensación de que prima el aspecto técnico sobre los demás. En Málaga, me di cuenta de que al quitar la parte SIG, el mundo del SL no es lo mio. Demasiado mamoneo, mucho filosofo bohemio...y poca chicha. Me reafirmo en mi idea de que esto del SL a mí me gusta porque lo miro desde el punto de vista técnico. La parte filosofico-moral-ético-política es absolutamente secundaria para mí. Que no quiere decir que no me parezca bonita y mejor que otros modelos...pero la verdadera ventaja para mí es la técnica. Claro, que soy un desarrollador...
-Nos invitaron a los ponentes a una cena en un barco, muy chula y divertida. Hicimos un grupo muy divertido entre la gente de gvSIG (CIT + Iver + Prodevelop), igoSoftware, OrbisGIS y un servidor. Jorge Sanz hizo algunas fotos de la noche pirata, que podeis ver a continuación.

SEXTANTE programming guide

2008-10-25T12:40:00.002+02:00

Está aún sin terminar, pero ya se puede acceder a la versión actual (que la voy cambiando casi a diario, porque ahora le dedico bastante tiempo a esto...) de la guía de programación de SEXTANTE.

Se trata de un texto en inglés destinado a todos los que quieren usar SEXTANTE desde su programas Java, o bien a implementar nuevos algoritmos sobre la base de SEXTANTE. Cubre un campo más amplio que la anterior guía de programación (ahora se pueden hacer más cosas con SEXTANTE, al ser una librería), y está actualizada a lo que tenemos hoy en día en el programa.

El texto está disponible en la web (en la sección "SEXTANTE for developers"), así como las fuentes en LaTeX en el repositorio SVN.

Espero que con esto la gente se anime a programar más sobre SEXTANTE y aparezcan nuevos desarrollos aportados por gente diversa.

Sobre numeros y versiones

2008-10-25T12:34:00.003+02:00

Para evitar que la gente se confunda, una aclaración sobre los números de versión de SEXTANTE en la actualidad.

La última versión de SEXTANTE para gvSIG era la 0.53. La que ahora se puede descargar en la web es una versión más moderna, con mas cosas y muchos cambios, por lo cual debería ser algo mayor (por ejemplo, 0.6). No obstante, el cambio de enfoque es tan grande (de unas extensiones para gvSIG a una librería independiente), que lo considero como si fuera un nuevo programa, y por eso empiezo desde el principio. Es decir, borrón y cuenta nueva.

La versión 0.1 viene a indicar que es aún un producto reciente y ha de madurar, a pesar de que contenga ya más extensiones que la última versión sobre gvSIG. Hay que testear mucho aún, pero es probable que las versiones avancen rápido, ya que con todo el trabajo hecho anteriormente, alcanzar una estabilidad mayor uea la que había entonces creo que va a ser rápido.

En resumen, hay que ver SEXTANTE como una herramienta nueva que por ahora tiene en la calle una única versión, la 0.1. Asi evitamos líos y confusiones ;-)

Listas

2008-10-23T10:40:00.002+02:00

Acabo de activar dos listas de correo para el proyecto SEXTANTE, que espero que sirvan como medio de comunicación para todos los interesados en el programa. Aunque hay mucho movimiento relativo a SEXTANTE en la lista de gvSIG, ahora ya no es la única plataforma sobre la que SEXTANTE funciona, así que es necesario tener una lista que sirva de punto de encuentro para todos los usuarios.

Las listas son sextante-users y sextante-devel, para usuarios y desarrolladores respectivamente. Podéis daros de alta en la siguiente dirección:

http://forge.osor.eu/mail/?group_id=13

Primera version liberada

2008-10-15T16:36:00.002+02:00

Poco a poco vamos avanzando en la mejora de la librería. Hoy he puesto en la web una primera versión compilada, así como algunos paquetes que permiten instalar el conjunto de herramientas de SEXTANTE en diversos programas, empezando por supuesto, por gvSIG. Con esto espero que los usuarios de gvSIG se vayan moviendo hacia estas nuevas versiones y otros usuario de otras aplicaciones se suban al carro de SEXTANTE, así como que los desarrolladores lo tengan más facil para usar la librería.

Se trata aún de una versión con mucho por pulir, pero es un buen primer paso.

Para acompañar esto, he redirigido la pagina del programa (www.sextantegis.com) al wiki de OSOR, donde a partir de ahora voy a mantener toda la información y toda la actividad de cara al público. Mantener dos páginas se me hace mucho más difícil y el tiempo de trabajo hace mucho que me es demasiado escaso como para atender a todas las necesidades del proyecto, así que de este modo me hago la vida más sencilla. Por el momento la página está en inglés, pero en breve actualizaré la parte en español.

Habrá otra versión pronto y más cambios adicionales en todo lo relativo al proyecto, así que cualquier comentario es bienvenido para encauzar todos esos esfuerzos por venir.

Más del FOSS4G

2008-10-07T12:54:00.004+02:00

Además de las cosas que puse en la última entrada, hay algunos otros asuntos que merecen ser mencionados sobre la conferencia de Sudáfrica, y que pongo a continuación:

Nuevos algoritmos: Una de las cosas que me han entusiasmado más de ver cómo la gente responde a la nueva situación de SEXTANTE es el hecho de que empieza a considerarse como una plataforma para estandarizar el acceso a algoritmos geoespaciales, y que empiezan a darse cuenta de que no existe en este momento algo similar y de que la importancia que puede cobrar de aquí en adelante es grande (esperemos que así sea...). Esto hace que haya ya ciertos grupos que se interesen en migrar sus algoritmos de análisis para beneficio propio y de todas aquellas otras aplicaciones que actualmente usen SEXTANTE, así como de todas las que en un futuro puedan emplearlo. Las propuestas mas interesantes son:

pgRouting. Con Anton Patrushev(que como buen ruso es hospitalario y me ha invitado a ir a verle en Enero a Novosibirsk cuando pase por alli, cosa que haré), tienen intención de migrar código en C++ de sus rutinas de análisis de rutas.
uDig. Recientemente se ha publicado una extensión para triangulación y calculo de curvas de nivel directamente desde una capa de puntos, que se ha desarrollado dentro del Google Summer of Code. Quieren adaptarla a SEXTANTE para que pueda seguir corriendo en uDig, pero también en otras aplicaciones.
JGrass. Tengo que echarle un vistazo con más detalle, pero creo que puede haber mucha colaboración aquí, ya que los algoritmos cuadran bien, algunos de ellos no están en SEXTANTE, y además JGrass está basado en uDig, que es una plataforma en la que ahora SEXTANTE corre y sobre la que se está haciendo bastante trabajo. Andrea Antonello parece interesado, aunque es cierto que durante el congreso no hablamos mucho del tema a pesar de pasar bastante tiempo juntos (hay que hablar de otras cosas, no solo de SIG vive el hombre...)

Todo esto enlaza además con la decisión que la gente de gvSIG tomó en una reunión que tuvimos hace algunas semanas, y según la cual a partir de ahora tratarán de implementar todos los algoritmos de análisis de gvSIG sobre la base de SEXTANTE, incluyendo los ya existentes (geoprocesos, etc.)

Code sprint: la mayoría de los presentes hicimos un intenso "beer sprint" la noche anterior(había que despedirse del congreso y de los otros participantes que ya se iban...), así que la resaca no nos permitió ser muy productivos, pero aun así creo que saqué un par de cosas en claro. Ayude a solucionar algunos problemas en uDig, y el funcionamiento es cada vez mejor, acercándonos poco a poco a algo suficientemente estable como para publicarse. Ademas, hice un poco de wiki sprint y añadí mas información al wiki del programa, en la parte de desarrolladores y en otras secciones, que retoqué o amplié.

Nuevas ideas para mejoras: Entre lo que he visto y las vueltas que le he dado a la cabeza en los pocos ratos libres, me he traído algunas ideas nuevas para seguir mejorando SEXTANTE de forma progresiva. Hablar con alguna gente a la vuelta también me ha dado nuevas perspectivas sobre hacia donde llevar SEXTANTE. Éstas son algunas de ellas en orden prioritario de inteŕes, las cuales definen más o menos mis lineas de trabajo durante los próximos meses:

Rellenar huecos básicos: SEXTANTE tiene cosas muy raras y poco comunes, pero le faltan otras muy básicas. Herramientas de análisis vectorial como la intersección o la unión no están aún, en general por pereza mía al ver que gvSIG ya las trae. Pero ahora ya gvSIG no va a estar siempre detrás, así que es prioritario implementar estos algoritmos, ya que el gran público los usa a diario. Entre ayer y hoy ya he añadido la diferencia, la diferencia simétrica, la unión y la intersección. La operación "disolver" tengo que pensarla un poco más, porque los parámetros de configuración son algo diferentes, y quizás sea bueno hacerles una interfaz especifica.
Permitir el uso de interfaces de usuario específicas en el modelizador. Por ejemplo, para que pueda utilizarse la calculadora de mapas con sus botones y todo dentro del modelizador.
Mejorar la gramática del modelizador. Añadir mas elementos a las descripciones de las salidas, como el numero de bandas que van a tener (cuando pueda saberse de antemano, claro está), el tipo de capa vectorial, etc. Esto hará el modelizador más robusto.

Desde Sudafrica

2008-10-03T14:20:00.003+02:00

Mientras Laura y Salva acaban su parte del taller (la mia viene justo despues), aprovecho para comentar rapidamente algunas de las cosas que he hecho hasta el momento, que creo que son bastantes y muy interesantes para el desarrollo del proyecto en general. Perdon por la falta de acentos y enyes...estoy en uno de los ordenadores que la organizacion nos ha dejado en el aula del taller...

Como hice una lista de cosas a hacer, sigo el mismo esquema para ver si las he cumplido todas ;-)

Reunirme con Mitasova, Markus Neteler y Tyler Mitchell para discutir nuestro libro que ya está en marcha. Helena y Tyler no han venido, pero Markus y yo hemos hecho algo de trabajo en el indice del libro, y hemos movido algunos hilos para 'fichar' co-autores que puedan echar un cable.
Presentar la actividad del capitulo español de OSGeo, en representación de los que no han podido ir. 2 minutos de charla al final de la conferencia. Poco que destacar aqui.
Presentar el modelizador gráfico de SEXTANTE en una charla. Exito rotundo. La sesion incluia resumen de actividades de GeoServer(por Chris Holmes), GDAL (por Frank Warmerdam) y de gvSIG(por Miguel Montesinos), o sea que era de pesos pesados, y mi charla era la ultima. El ordenador se me apago un poco antes de mi turno, asi que lo tuve que reiniciar conectado ya al proyector, perdiendo unos minutos. Chris, que era el chair de la sesion, aprovecho la ocasion para deleitar al personal con la mejor presentacion que me han hecho nunca, contando desde como nos conocimos el y yo hasta su opinion sobre el proyecto, y algunas otras cosas mas de forma relajada y simpatica. Viniendo de el, y teniendo en cuenta que no dijo mas que cosas buenas, la charla casi merecia la pena solo con eso. La demo salio sobre ruedas y tuve muchas preguntas al final, especialmente de Warmerdam, que demostro bastante interes en SEXTANTE e incluso dijo que le echaria un vistazo para intentar hacer su "primer proyecto en Java", incorporando un par de cosas que tenia hechas recientemente para analisis de imagenes.En resumen, mejor imposible.
Presentar el libro libre SIG en otra charla. El libro se presento en una charla el miercoles, y dio lugar a una segunda reunion del grupo de educacion de OSGeo, que habiamos mantenido una primera el martes por la tarde. La sala estaba llena y, pese a que el libro no es en ingles, la gente mostro interes y muchas ganas de colaborar. Lo mas destacable es que la fundacion Shuttelworth tal vez apoye el libro como parte de un programa de creacion de libros libres. Supondria la primera aportacion economica al proyecto, probablemente para ser empleada en traducciones. Comentar tambien que he cambiado mi enfoque actual de trabajo en el libro, a raiz de lo que he visto y para intentar agilizar el trabajo. Comentare mas al respecto en breve.
Dar hora y media de taller sobre SEXTANTE-gvSIG. Esto todavia no lo he hecho, sera dentro de 20 minutos :-P
Trabajar con la gente de uDig en la integración de SEXTANTE. Manyana es el code sprint. Jesse ha hecho algunos avances y manyana remataremos la jugada
Reunirme con Erwan Bocher, del equipo de OrbisGIS, que están tambien interesados en incorporar SEXTANTE a su programa (por cierto, un SIG muy interesante y prometedor...). Me ha encantado lo que he visto de OrbisGIS y ha ellos les ha encantado lo mio. Tenemos sobre la mesa un posible contrato de colaboracion. En un par de semanas me reuno en el congreso de SL de Malaga con Fernando, desarrollador del proyecto, para hacer cosas juntos, y despues volveremos a hablar para planificar la forma de colaboracion. Esta va a ser una linea de trabajo muy importante en los proximos meses, si todo sale como espero.
Reunirme con la gente de 52N para ver cómo servir procesos de SEXTANTE y cómo incorporar su cliente WPS dentro de SEXTANTE. Hable con ellos y Laura tambien les mostro su adaptacion de SEXTANTE a 52N. Estan mas interesados en la parte de servidor, y en breve tendran algoritmos disponibles que se basen en SEXTANTE. El 18 de noviembre me reuno con ellos, incluyendo a Theodor, cabecilla del equipo, que no ha podido acudir a esta cita.

Planes Sudafrica

2008-09-18T16:37:00.002+02:00

Aunque el congreso en sí no empieza hasta el 29, esta noche vuelo hacia Ciudad del Cabo para pasar algunos dias de relax por aquellas tierras antes de entrar en faena. No me vendrán mal, ya que la semana promete ser la mas intensa en la historia de SEXTANTE, al menos en lo que a colaboraciones se refiere. Esperemos que tambien sea la mas productiva...

Éste es, brevemente, el resumen de cosas que voy a hacer durante los dias que dura el evento:

Reunirme con Mitasova, Markus Neteler y Tyler Mitchell para discutir nuestro libro que ya está en marcha.
Presentar la actividad del capitulo español de OSGeo, en representación de los que no han podido ir (este tipo de cosas las suele hacer Lorenzo, que es el showman...pero como no va, me han entruchado)
Presentar el modelizador gráfico de SEXTANTE en una charla
Presentar el libro libre SIG en otra charla
Dar hora y media de taller sobre SEXTANTE-gvSIG
Trabajar con la gente de uDig en la integración de SEXTANTE
Reunirme con Erwan Bocher, del equipo de OrbisGIS, que están tambien interesados en incorporar SEXTANTE a su programa (por cierto, un SIG muy interesante y prometedor...)
Reunirme con la gente de 52N para ver cómo servir procesos de SEXTANTE y cómo incorporar su cliente WPS dentro de SEXTANTE

Muchas cosas, y si consigo hacer la mitad me volveré contento y sin duda con mucho trabajo que hacer. En la medida de lo posible, intentaré ir contando los avances que haga (incluyendo si veo leones y pingüinos...)

SIG artístico

2008-09-10T17:38:00.002+02:00

Que el arte y la ciencia tienen una estrecha relacion es algo que se sabe desde antiguo. Para demostrarlo, aqui va un pequeño ejemplo sobre como hacer un poco de arte gráfico con SEXTANTE.

Resulta que Antonio está probando uno por uno los algoritmos de SEXTANTE, para comprobar que al realizar los ajustes necesarios para incorporarlos en la librería, no he introducido fallos. Así que, si encuentra algo que no funciona o un comportamiento extraño, escribe un pequeño informe y luego yo intento resolver el problema. Hoy, al intentar calcular una envolvente circular mínima, le ha salido lo siguiente.

Un bug, sin duda...pero es chulo, ¿verdad? ;-)

Ampliando fronteras

2008-09-04T10:56:00.003+02:00

A pesar de que todavía no he liberado ni una sola versión oficial y solo se puede acceder por el SVN a las fuentes, desde que SEXTANTE se ha convertido en una librería no paran de aparecer nuevas propuestas y la gente se muestra cada vez más interesada en emplearla. Esto me reafirma en la idea de que ha sido una decisión muy acertada, y me impulsa a seguir difundiendo SEXTANTE entre la comunidad de desarrolladores SIG, con la esperanza de que sean cada vez más los que aporten al proyecto.

Dejo tres de ejemplos, en diferentes estados de desarrollo, de trabajos relacionados con SEXTANTE:

1) Talend/Spatial Data Integrator. Ya lo comenté en otra entrada. La gente de Camp2Camp está incorporando componentes basados en SEXTANTE e intentarán tener una versión son ellos incluidos para el congreso de Sudáfrica de dentro de 3 semanas.

Algo más de información en esta pagina web.

2) OpenJUMP. SEXTANTE corre en OpenJUMP en su practica totalidad, casi del mismo modo que lo hace en la implementación de referencia (gvSIG). Estoy a la espera, de todas formas, de que la comunidad de desarrolladores de OpenJUMP se meta en serio a revisar los enlaces entre OpenJUMP y SEXTANTE, lo que seguramente mejorará el rendimiento y la estabilidad.

Uma imagen de muestra:

3) uDig. Este es un trabajo en el que yo no participo prácticamente, ya que no tengo experiencia en trabajar con la interfaz gráfica de eclipse (SWT), necesaria para implementar cosas bajo uDig. Ello hace difícil el incorporar los componentes gráficos de SEXTNATE, así que los chicos de uDig, con Jesse Eichar a la cabeza, están haciendo un trabajo increíble rediseñando todas las interfaces. Los resultados son mucho más bonitos y aparentes que los originales, como se puede ver en la siguiente imagen.

Viajes SEXTANTE

2008-08-13T20:21:00.001+02:00

Ahora que todos viajan en verano para irse de vacaciones, y yo sólo viajo para ir de trabajo voy a aprovechar para poner un pequeño mapa de los sitios a los que he ido (o tengo confirmada alguna charla próximamente) en mi labor de creador de SEXTANTE, para contar algo del programa, dar una charla, un curso, o algo similar. La verdad es que son ya unos cuantos lugares.

A ver si puedo añadir muchos más, especialmente fuera de Europa, que aún hay pocos.

View Larger Map

Reunion CampToCamp

2008-08-09T16:08:00.001+02:00

Recién llegado de Suiza, aquí van algunos comentarios sobre mi reunión con la gente de CampToCamp, probablemente la más productiva de cuantas han tenido lugar en toda la historia de SEXTANTE, y en ejemplo inmejorable de trabajo en equipo.

Había estado trabajando bastante durante los últimos días, intentando llegar a esta reunión con algo "tangible", por supuesto dentro de la medida de lo posible. Es decir, tener algo que pudieran utilizar al menos para hacerse una idea de como podría emplearse la librería SEXTANTE en sus desarrollos, pero siendo consciente de que la librería es un desarrollo de gran envergadura al que le queda mucho tiempo por delante antes de poder tener algo estable. De hecho, a medida que voy desarrollando me doy cuenta de que queda más por hacer, y el paso de ser un conjunto de extensiones para gvSIG a ser una librería de algoritmos de análisis es una tarea muy grande que va a requerir gran esfuerzo y tiempo. Lo cual no quiere decir que no puedan tenerse resultados a medio camino y elementos ya utilizables, como ahora veremos.

El primer día de reunión presenté la estructura de la librería y el enfoque que le estoy dando, para que me dieran su opinión y trabajar en pulir el diseño general. La estructura gustó y aportaron algunas ideas sencillas en las que me puse a trabajar, aunque en general les pareció bien mi planteamiento y no fueron muchos los cambios. Básicamente, el diseño que estoy planteando de SEXTANTE les pareció muy bueno para una integración entre SEXTANTE y Talend (o cualquier otra herramienta...).

Jesse Eichar (desarrollador principal de uDig, y por tanto buen conocedor de GeoTools) estuvo toda la mañana trabajando en crear los binding entre GeoTools y SEXTANTE, de forma que se recubran las clases de GeoTools para que puedan ser aprovechadas por SEXTANTE. Es decir, que si tienes una capa vectorial que la has obtenido usando GeoTools, puedas pasársela a SEXTANTE para que trabaje con ella. A final del día ya teníamos listos los bindings para GeoTools 2.4 y la reciente 2.5, y cuatro pequeños ejemplos de uso (por supuesto, todo está ya en el SVN). Es decir, SEXTANTE ya funciona sobre GeoTools. En el SVN se puede encontrar también un pequeño "GIS", que lo único que hace es abrir capas usando GeoTools, y permite ya usar todas las herramientas de SEXTANTE (modelizador, linea de comandos, etc.). Y todo eso en un día.

El segundo día, Francois cogió SEXTANTE y el trabajo hecho por Jesse y consiguió meter en Talend 5 nuevos componentes basados en SEXTANTE, entre ellos algunos que usan capas raster y otros con capas vectoriales,para dar mas variedad. El ejemplo de modelo que aparece en el pequeño manual de SEXTANTE (calculo del indice de humedad topográfica a partir de pendiente y acumulación de flujo), ya se puede hacer en Talend, que genera automáticamente el código correspondiente y puede ejectura el modelo.

El tercer día fue mas relajado, revisando lo que habíamos hecho y discutiendo algunos temas nuevos, como la integración de SEXTANTE en uDig o el uso de la interfaz de procesos de GeoTool para integrar SEXTANTE en GeoServer el día de mañana. Hicimos mucho trabajo y dejamos en el aire muchas ideas, lo cual es una buena señal.

En definitiva, un paso de gigante para la librería SEXTANTE, que va cogiendo una proyección mucho mayor y poco a poco tomando forma. Esperemos que el trabajo siga a este ritmo durante mucho tiempo.

Los que estéis más interesados podéis echar un vistazo al SVN o mirar el wiki, donde estoy intentando añadir información a medida que voy teniendo cosas acabadas, para así conseguir más gente interesada que pueda comenzar a trabajar con SEXTANTE.

Curso de análisis geoespacial con SEXTANTE

2008-07-22T14:32:00.002+02:00

Tenía ganas de hacer un curso de SEXTANTE más extenso que los habituales talleres de unas pocas horas, y por fin he encontrado el momento y la forma ideal de hacerlo.

En colaboracion con Càrol Puig, de la Universidad Politécnica de Cataluña, vamos a hacer un curso orientado a todos aquellos que quieran aprender no sólo a manejar el programa en profundidad sino, especialmente, a comprender los mecanismos que residen debajo de los principales algoritmos. El curso además donará sus beneficios a Ingenieros Sin Fronteras, con lo cual le añadimos una bonita componente social que creo que lo hace más interesante aún.

Aunque yo impartiré la mayoría del curso, contaré con gente que hara algunas de las charlas, para así hacerlo más dinámico. Por ahora la gente parece interesada (aunque hay mucha más gente que pide que el curso sea on-line, cosa por el momento descartada), y esperamos que venga gente de fuera, razón por la cual el curso es en inglés, para así poder recibir asistentes internacionales.

Sin entreterme más, remito a todos los interesados a la web del curso.

Librería SEXTANTE

2008-07-11T15:02:00.003+02:00

Como mencioné en una entrada anterior, hay cambios a la vista en SEXTANTE...y no son precisamente pequeños.

Después de ver las necesidades de muchos otros proyectos SIG durante estas semanas, uno se da cuenta rápidamente de que hay un nicho vacío en lo que a análisis respecta. Muchos proyectos requieren análisis, pero no hay una librería que pueda proporcionarles los algoritmos correspondientes. Y no parece que nadie este dedicando esfuerzos a desarrollar esos algoritmos y esa librería.

Por otra parte, SEXTANTE tiene una gran colección de algoritmos de análisis geoespacial, aunque para utilizarlos se requiere de gvSIG por debajo. Así que lo más lógico sería tratar de independizar SEXTANTE, de tal forma que gvSIG pueda seguir llamando a esos algoritmos, pero otros programas lo puedan hacer de forma igual de sencilla.

La decisión de hacer esto, como es fácil comprender, no es tan sencilla de tomar, y le he dado unas cuantas vueltas antes de lanzarme, pero creo que las ventajas son múltiples.

Hay bastante trabajo que hacer, pero poco a poco se irán añadiendo los elementos de SEXTANTE y es probable que con este planteamieto se pueda encontrar más apoyo en términos de desarrollo (ahora mismo SEXTANTE es popular en lo que a usuarios respecta, pero nadie salvo yo mismo esta programándolo, y no parece que nadie vaya a animarse...), ya que SEXTANTE será una herramienta útil para desarrolladores en el ámbito SIG.

La idea es que la librería contenga los algoritmos, pero también, separadamente, las partes gráficas ya desarrolladas, de forma que sea igualmente sencillo integrarlas en distintos GUI. Y por supuesto, se pueden crear otras y desde ellas llamar a los algoritmos directamente, o bien hacerlo sin interfaz gráfica alguna (linea de comandos, procesos remotos, etc.)

Por el momento, pocos detalles más. Yo estoy dedicando ya todo mi tiempo de trabajo a ir preparando la arquitectura de la librería, así que no habrá muchas mejoras en la versión actual sobre gvSIG, aunque es probable que en un tiempo sí que saque algo con algunas cosillas y bugs que he corregido desde que se publicó la 0.53.

Para usuarios (que son la mayoría de los que deben leer este blog), por el momento deberán contentarse con la versión que hay o con esa pequeña actualización cuando salga, y desde ahí todavía no tengo claro cómo será el trabajo que haré. Hace falta desarrollar cosas para llamar a SEXTANTE librería desde cada SIG, y la idea, como parece lógico, no es que yo tenga que hacerlo para todos los SIG o aplicaciones que vayan a usar SEXTANTE, sino que cada cual haga las suyas. No obstante, el caso de gvSIG es un poco distinto por la vinculación que ha existido (y existe) entre los proyectos, así que sí que es probable que esa parte la haga yo. Al menos sobre la 1.1, porque además necesito alguna plataforma para testear y ver cómo marchan las cosas. Para la 2.0, cuando la saquen ya se verá, pero bueno queda aún mucho tiempo. Quizás sea el momento de integrar el análisis plenamente en gvSIG y definir un marco unificado para procesos, y esa labor quedaría más en el lado de gvSIG, que por supuesto dispondría de la potencia de la librería SEXTANTE para usarla de la forma que corresponda.

Para empezar a poner en acción la librería, me ha invitado la gente de camptocamp a pasar tres días con ellos a principios de agosto para intentar desarrollar nuevos elementos para Talend basados en SEXTANTE. Intentaré ver con detalle las necesidades que tienen, para hacer un diseño mejor. Por el momento, no arranca mal la cosa, aunque yo quería parar ya los viajecitos por una temporada...pero bueno, la ocasión lo merece :-P

Por cierto, se supone que en español no debería decirse libreria sino biblioteca ¿no? Eso dicen los más puntillosos...no sin razon. :-)

AGIT, Salzburgo

2008-07-04T10:39:00.002+02:00

Ahí van unas líneas breves sobre el AGIT, aquí en Salzburgo, donde estoy a punto de comenzar el taller de SEXTANTE en apenas una hora. De hecho, estoy escribiendo esto con el ordenador ya conectado al cañón y probando que todo funcione correctamente, que aunque los austriacos son serios y responsables como los alemanes y parecen tenerlo todo bajo control, a veces las cosas fallan y es mejor cerciorarse.

En el anuncio del taller aparezco como "Víctor Playa"[sic], error mínimo e irrelevante, pero que demuestra que aquí tambien se equivocan y hacen pequeñas gañanadas. En la reunión de Bruselas se me anunciaba como miembro de la Universidad de Extramadura[sic], así que uno ya está en el fondo acostumbrado a estas cosillas :-)

De camino hacia aquí me encontré con Olaf Conrad (SAGA) en el tren, lo cual ya fue una interesante coincidencia. A medida que ayer daba vueltas por los stands (demasiado comercial para mi gusto, aunque algunos cacharillos en el stand de Trimble eran realmente flipantes y dignos de echarles un vistazo), no paraba de encontrarme gente conocida. Marc Compte, del SIGTE; un par de compañeros que estudiaron en mi escuela y están de hecho apuntados al taller de SEXTANTE; uno de la organización del AGIT que viene de Rumanía y fue alumno mío en el curso de geoestadística de Portici...y un largo etcétera. Cuanto menos te esperas conocer gente, más amigos te encuentras, que no está nada mal, la verdad.

El unico evento interesante al que he asistido fue la reunión de usuarios de SAGA, con unas 25 personas, donde se han presentado cosas interesantes y algunas de las ideas nuevas para continuar el desarrollo del programa, que lleva estancado algún tiempo. Si tuviera más tiempo libre me gustaría trastear algo más con el código de SAGA, pero la verdad es que hay muchas más cosas antes por hacer...así que mi presencia en la reunión fue más para encontrarme con viejos conocidos que por otros motivos más técnicos.

El taller va a ser el clásico, aunque intentaré añadir cosas nuevas. Todo sea por variar un poco, que si no la cosa se hace monótona.

Y después de esto, vuelta a casa y a la rutina, a ver si vuelvo a coger el ritmo bueno de programar y hacer código, que ya lo echo de menos. En 10 días tendría que estar en Ecuador, pero por suerte han anulado esa cita y queda aplazada hasta noviembre, con lo que tendré tiempo para programar un poco.

Aunque no he podido darle a las teclas mucho, estos días de reunirme con gente y ver otros proyectos me han dado una nueva perspectiva sobre SEXTANTE, y tengo muchas ideas y cambios previstos. Se acercan días de gran actividad y grandes cambios en SEXTANTE. A medida que vaya poniéndolos en práctica, lo iré contando por aquí, como es habitual.